More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2136 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 660 aa  1283    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  51.19 
 
 		 703 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  46.65 
 
 		 631 aa  256  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  50.55 
 
 		 705 aa  249  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.77 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  49.45 
 
 		 534 aa  228  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  51.25 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  47.04 
 
 		 503 aa  227  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  45.73 
 
 		 525 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  47.47 
 
 		 468 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  45.9 
 
 		 659 aa  214  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  42.94 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  45.22 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  47.81 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 776 aa  210  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  45.15 
 
 		 675 aa  210  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 562 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.05 
 
 		 678 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 		 674 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.82 
 
 		 521 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.74 
 
 		 596 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0726  serine/threonine protein kinase  47.14 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  43.49 
 
 		 563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  45.82 
 
 		 377 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.52 
 
 		 532 aa  197  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  44.37 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 766 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2069  serine/threonine protein kinase  44.71 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.832371  normal  0.49505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  45.25 
 
 		 422 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 		 419 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  40.34 
 
 		 418 aa  194  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 		 543 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.06 
 
 		 668 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  45.06 
 
 		 855 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3106  serine/threonine protein kinase  49.45 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  46.38 
 
 		 575 aa  189  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.14 
 
 		 531 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  42.6 
 
 		 487 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  47.84 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 		 595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 		 461 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  36.76 
 
 		 501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.84 
 
 		 659 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 		 674 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  44.41 
 
 		 554 aa  184  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  46.67 
 
 		 466 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  43.27 
 
 		 673 aa  183  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  43.65 
 
 		 621 aa  181  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  44.49 
 
 		 695 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 		 385 aa  178  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.14 
 
 		 642 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  39.72 
 
 		 641 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  45.57 
 
 		 581 aa  178  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 		 345 aa  176  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 		 650 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.79 
 
 		 612 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  42.9 
 
 		 559 aa  174  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  47.29 
 
 		 962 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 		 553 aa  173  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5900  serine/threonine protein kinase  45.85 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  42.51 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 564 aa  171  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 		 617 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  43.27 
 
 		 1029 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  44 
 
 		 638 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  40.19 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 		 666 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.49 
 
 		 627 aa  169  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  39.92 
 
 		 605 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.47 
 
 		 596 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.91 
 
 		 518 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  42.7 
 
 		 419 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  42.18 
 
 		 301 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5882  serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 		 296 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0086799  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  41.45 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  37.84 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  43.12 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 		 938 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  40.8 
 
 		 468 aa  162  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 316 aa  162  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1248  serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 		 543 aa  161  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.987546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.39 
 
 		 757 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.84 
 
 		 645 aa  161  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 		 499 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 		 264 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 		 581 aa  161  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.27 
 
 		 641 aa  160  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.32 
 
 		 650 aa  160  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 866 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  41.39 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>