More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2939 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
445 aa  875    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  55.52 
 
 
462 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.88 
 
 
850 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  46.51 
 
 
425 aa  196  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  40.07 
 
 
457 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  41.33 
 
 
907 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
627 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  42.53 
 
 
557 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  38.1 
 
 
620 aa  186  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.75 
 
 
825 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.04 
 
 
747 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.78 
 
 
650 aa  182  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.03 
 
 
579 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  40.53 
 
 
623 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  43.35 
 
 
646 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
618 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.33 
 
 
757 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  36.23 
 
 
869 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  41.09 
 
 
618 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
612 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  42.58 
 
 
1032 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 
866 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.58 
 
 
647 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.75 
 
 
662 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 
641 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  38.91 
 
 
1122 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.19 
 
 
641 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  40.22 
 
 
654 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 
642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
565 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.16 
 
 
551 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  42.19 
 
 
1032 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  42.96 
 
 
675 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 
613 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  38.81 
 
 
604 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
666 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  36.18 
 
 
692 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  42.26 
 
 
450 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
691 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 
776 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  37.87 
 
 
820 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  39.48 
 
 
596 aa  171  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
615 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.14 
 
 
681 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  39.93 
 
 
1358 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  40.5 
 
 
597 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
673 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.22 
 
 
528 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
750 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 
573 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 
559 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0235  protein kinase  40.45 
 
 
352 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.692705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.25 
 
 
642 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  42 
 
 
990 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 
628 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 
455 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.7 
 
 
1072 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  38.06 
 
 
621 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.48 
 
 
602 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.87 
 
 
664 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.08 
 
 
662 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  35.91 
 
 
658 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  36.98 
 
 
703 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  36.23 
 
 
638 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  36.33 
 
 
790 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.06 
 
 
584 aa  167  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
632 aa  167  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
982 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
562 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  36.43 
 
 
672 aa  166  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  40.44 
 
 
700 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
706 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.63 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  41.86 
 
 
982 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  37.92 
 
 
651 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  37.54 
 
 
604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  44.98 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  40.34 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.06 
 
 
627 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.04 
 
 
613 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.54 
 
 
1076 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  42.25 
 
 
985 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  39.31 
 
 
612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
710 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  39.16 
 
 
574 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.31 
 
 
1072 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  40.6 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.51 
 
 
1044 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  41 
 
 
599 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.31 
 
 
707 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
650 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.69 
 
 
1023 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
360 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  38.08 
 
 
561 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  44.17 
 
 
1018 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  37.36 
 
 
661 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  39.78 
 
 
586 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0290  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>