More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5083 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1046    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  30.02 
 
 
1219 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
535 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  39.52 
 
 
473 aa  98.6  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  33.59 
 
 
1217 aa  90.9  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
622 aa  90.1  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
498 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  33.74 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.29 
 
 
533 aa  80.9  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  30.77 
 
 
1224 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  31.46 
 
 
690 aa  80.5  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31870  hypothetical protein  33.19 
 
 
872 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 
556 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 
1652 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  35.06 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  28.37 
 
 
502 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
730 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  72  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
862 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  34.72 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 
612 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  34.72 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  34.72 
 
 
623 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 
657 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  23.84 
 
 
656 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.85 
 
 
715 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
487 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.19 
 
 
703 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.84 
 
 
657 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  26.01 
 
 
593 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5305  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.16 
 
 
581 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
679 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7753  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.04 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  21.93 
 
 
653 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  21.93 
 
 
662 aa  67.8  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2236  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.48 
 
 
535 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
666 aa  67.4  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
985 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
497 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 
614 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
612 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  32.43 
 
 
532 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
982 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.08 
 
 
403 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.46 
 
 
607 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  31.73 
 
 
503 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  26.54 
 
 
672 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
573 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
636 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9039  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
594 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  30.54 
 
 
1209 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.87 
 
 
591 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0943  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.86 
 
 
489 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal  0.789062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  24.72 
 
 
625 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
757 aa  64.3  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
982 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.3 
 
 
668 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.56 
 
 
546 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1541  hypothetical protein  31.58 
 
 
443 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907452  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
636 aa  63.9  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 
585 aa  63.9  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.46 
 
 
602 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
888 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 
517 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
894 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
855 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0456  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
490 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.959747  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 
567 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  21.69 
 
 
651 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
465 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.35 
 
 
647 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  26.67 
 
 
796 aa  62  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.12 
 
 
562 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.82 
 
 
863 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
338 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.08 
 
 
652 aa  61.6  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
468 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 
525 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.25 
 
 
676 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.79 
 
 
584 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.87 
 
 
707 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
915 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  20.69 
 
 
638 aa  60.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.86 
 
 
579 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  22.92 
 
 
621 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
480 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  24.05 
 
 
641 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 
624 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>