More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4534 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 679 aa  1325    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  53.76 
 
 		 730 aa  558  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  34.1 
 
 		 498 aa  132  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  34.81 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 556 aa  107  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  31.77 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  31.6 
 
 		 532 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  32.68 
 
 		 596 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.19 
 
 		 627 aa  98.6  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 535 aa  98.2  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.71 
 
 		 676 aa  94.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 612 aa  94.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 666 aa  93.2  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  30.1 
 
 		 403 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.68 
 
 		 546 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  29.9 
 
 		 505 aa  91.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.32 
 
 		 691 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 		 502 aa  91.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.32 
 
 		 692 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 625 aa  89.4  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 		 559 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 503 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.5 
 
 		 614 aa  89  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 624 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 624 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 624 aa  88.6  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 763 aa  88.2  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 		 612 aa  88.2  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  31.41 
 
 		 1217 aa  87.8  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  29.22 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  28.95 
 
 		 625 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0943  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.89 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal  0.789062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.52 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.58 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.72 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  27.51 
 
 		 668 aa  84.7  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.04 
 
 		 625 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  28.85 
 
 		 626 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  30.03 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 580 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.72 
 
 		 602 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.65 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.97 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0363  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 497 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  29.8 
 
 		 758 aa  82  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.21 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.06 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  28.52 
 
 		 736 aa  82  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.83 
 
 		 693 aa  81.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 1085 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  29.02 
 
 		 623 aa  82  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  27.76 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  34.15 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  28.8 
 
 		 951 aa  80.9  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.88 
 
 		 613 aa  80.9  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 855 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.6 
 
 		 601 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  22.55 
 
 		 703 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  27.37 
 
 		 618 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.97 
 
 		 668 aa  79.7  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 562 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 596 aa  79.7  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.09 
 
 		 579 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  28.46 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.3 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.21 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.08 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.53 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.95 
 
 		 747 aa  77.8  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.36 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  28.29 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 651 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 419 aa  76.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 543 aa  76.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 646 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  24.5 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  24.21 
 
 		 641 aa  76.6  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  21.29 
 
 		 662 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 316 aa  77  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  24.84 
 
 		 621 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 		 465 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.03 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.22 
 
 		 627 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.92 
 
 		 603 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.22 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  29.47 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.97 
 
 		 1623 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0957  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>