More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4435 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
542 aa  1056    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  63.88 
 
 
559 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  56.93 
 
 
382 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  59.44 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  57.46 
 
 
445 aa  306  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  59.12 
 
 
419 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  54.77 
 
 
464 aa  297  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00760  probable pknA serine-threonine protein kinase  58.15 
 
 
704 aa  297  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  58.58 
 
 
497 aa  297  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  56.72 
 
 
581 aa  296  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  53.04 
 
 
436 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  57.3 
 
 
567 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  55.97 
 
 
610 aa  294  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  55.23 
 
 
562 aa  293  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  50.6 
 
 
443 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  50.6 
 
 
443 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  50.6 
 
 
443 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  60.31 
 
 
614 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  54.58 
 
 
614 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  52.12 
 
 
430 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  56.93 
 
 
431 aa  290  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  54.15 
 
 
533 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  57.45 
 
 
475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  58.52 
 
 
462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 
575 aa  283  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  49.72 
 
 
554 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  56.13 
 
 
498 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  54.17 
 
 
469 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  57.5 
 
 
538 aa  277  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  51.89 
 
 
473 aa  277  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0062  serine/threonine protein kinase  57.25 
 
 
548 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
556 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3676  serine/threonine protein kinase  57.69 
 
 
501 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.779668  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  51.44 
 
 
538 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  54.34 
 
 
1104 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  52.31 
 
 
568 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  55.15 
 
 
499 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  55.34 
 
 
444 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  50.94 
 
 
477 aa  263  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  51.7 
 
 
663 aa  263  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  52.53 
 
 
450 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0023  protein kinase  57.71 
 
 
481 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  50.71 
 
 
499 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
465 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  52.53 
 
 
596 aa  251  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
480 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  49.62 
 
 
518 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  43.68 
 
 
320 aa  243  7e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  49.21 
 
 
503 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  51.14 
 
 
522 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  44 
 
 
316 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  49.43 
 
 
602 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  51.19 
 
 
505 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  47.94 
 
 
763 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  45.29 
 
 
638 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  43.36 
 
 
593 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  49.43 
 
 
585 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 
673 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  49.44 
 
 
513 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  39.75 
 
 
621 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.23 
 
 
667 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 
517 aa  226  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.77 
 
 
591 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 
612 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.7 
 
 
627 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  46.04 
 
 
776 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.61 
 
 
584 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  49.05 
 
 
647 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  44.92 
 
 
651 aa  223  8e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.03 
 
 
598 aa  223  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.88 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.7 
 
 
652 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  43.19 
 
 
618 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  42.49 
 
 
703 aa  220  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  38.37 
 
 
625 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  46.76 
 
 
646 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
612 aa  219  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  43.91 
 
 
604 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.09 
 
 
650 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.05 
 
 
658 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.64 
 
 
641 aa  217  5.9999999999999996e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44 
 
 
603 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 
615 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.74 
 
 
700 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.86 
 
 
715 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  47.37 
 
 
613 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
666 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.97 
 
 
662 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
636 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
582 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  43.27 
 
 
609 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
691 aa  209  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.83 
 
 
676 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.86 
 
 
668 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  43.43 
 
 
723 aa  209  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  46.54 
 
 
502 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  39.85 
 
 
692 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  46.38 
 
 
598 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.77 
 
 
627 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>