More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0689 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  100 
 
 
796 aa  1648    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  75 
 
 
757 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  46.59 
 
 
696 aa  266  8e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.12 
 
 
655 aa  251  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  43.69 
 
 
721 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  44.56 
 
 
672 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 
723 aa  243  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.94 
 
 
607 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.85 
 
 
681 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 
710 aa  238  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  44.93 
 
 
658 aa  238  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.32 
 
 
728 aa  237  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.49 
 
 
707 aa  236  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.96 
 
 
662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  44.16 
 
 
468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  42.8 
 
 
642 aa  233  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.01 
 
 
718 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  41.39 
 
 
623 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.29 
 
 
661 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1997  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.55 
 
 
696 aa  228  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.38 
 
 
598 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
636 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.45 
 
 
602 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  40.28 
 
 
776 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 
673 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.34 
 
 
647 aa  224  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  42.97 
 
 
646 aa  223  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  36.66 
 
 
625 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.44 
 
 
658 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 
646 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  39.72 
 
 
403 aa  219  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.25 
 
 
627 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  37.97 
 
 
634 aa  217  8e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
666 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.85 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.55 
 
 
668 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  40.75 
 
 
708 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  39.64 
 
 
399 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.84 
 
 
653 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  37.23 
 
 
641 aa  214  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  42.45 
 
 
612 aa  212  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
398 aa  211  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
398 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
398 aa  210  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
502 aa  210  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  34.93 
 
 
651 aa  209  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  42.41 
 
 
444 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  41.07 
 
 
445 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.1 
 
 
579 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.84 
 
 
658 aa  205  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  42.37 
 
 
736 aa  204  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  40.51 
 
 
667 aa  204  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  36.59 
 
 
638 aa  204  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  40 
 
 
406 aa  204  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  41.47 
 
 
585 aa  203  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  41.04 
 
 
690 aa  203  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  37.17 
 
 
614 aa  202  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  40.79 
 
 
656 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 
612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  41.6 
 
 
497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  39.47 
 
 
593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.43 
 
 
627 aa  202  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  36.92 
 
 
662 aa  201  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  37.05 
 
 
623 aa  201  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.94 
 
 
662 aa  201  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 
382 aa  201  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  36.01 
 
 
625 aa  201  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  40.68 
 
 
498 aa  200  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.41 
 
 
681 aa  200  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  40.15 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 
559 aa  200  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
480 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.93 
 
 
715 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.26 
 
 
652 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.18 
 
 
591 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 
575 aa  199  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  40.68 
 
 
758 aa  198  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  39.59 
 
 
612 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.27 
 
 
601 aa  198  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.24 
 
 
660 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  40.27 
 
 
658 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 
465 aa  197  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.91 
 
 
843 aa  197  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.39 
 
 
505 aa  197  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  38.27 
 
 
668 aa  197  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 
657 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
691 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
657 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
657 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
657 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  39.07 
 
 
499 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
657 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.86 
 
 
657 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.76 
 
 
499 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  39.72 
 
 
660 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
657 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
657 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  33.42 
 
 
657 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  43.59 
 
 
464 aa  194  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  40.16 
 
 
568 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>