More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3077 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
708 aa  1395    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  81.19 
 
 
658 aa  475  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 
646 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  36.14 
 
 
710 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.22 
 
 
660 aa  341  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.09 
 
 
662 aa  332  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.55 
 
 
607 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  36.79 
 
 
660 aa  327  5e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  38.59 
 
 
623 aa  327  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.39 
 
 
655 aa  324  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  60.51 
 
 
642 aa  323  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  38.23 
 
 
672 aa  323  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  61.29 
 
 
661 aa  317  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  55.86 
 
 
681 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  35.91 
 
 
723 aa  308  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  60.51 
 
 
658 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  37.82 
 
 
658 aa  300  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  53.15 
 
 
707 aa  293  9e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.37 
 
 
696 aa  286  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  57 
 
 
612 aa  280  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.67 
 
 
664 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  32.52 
 
 
625 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.63 
 
 
681 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  54.45 
 
 
721 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  50 
 
 
728 aa  268  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  33.19 
 
 
668 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  32.1 
 
 
625 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  51.42 
 
 
636 aa  264  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
690 aa  264  4.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  54.61 
 
 
718 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.49 
 
 
406 aa  263  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  49.82 
 
 
403 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  31.34 
 
 
736 aa  262  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.78 
 
 
662 aa  261  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  30.35 
 
 
667 aa  258  4e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  49.29 
 
 
399 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  52.06 
 
 
398 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.44 
 
 
618 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
398 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
398 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1997  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  52.8 
 
 
696 aa  248  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.38 
 
 
667 aa  246  8e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 
632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.71 
 
 
627 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.03 
 
 
657 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
657 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
657 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
657 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  29.72 
 
 
641 aa  239  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.66 
 
 
668 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  51.84 
 
 
843 aa  237  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  30.21 
 
 
656 aa  237  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 
657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 
657 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
657 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
657 aa  234  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
657 aa  234  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
657 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2972  protein kinase  49.26 
 
 
402 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  44.49 
 
 
625 aa  230  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
691 aa  229  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.99 
 
 
638 aa  228  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  39.61 
 
 
796 aa  227  6e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  27.53 
 
 
634 aa  227  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.11 
 
 
591 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  42.9 
 
 
624 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  42.9 
 
 
624 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  42.9 
 
 
624 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  25.4 
 
 
666 aa  223  9.999999999999999e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.08 
 
 
653 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  42.6 
 
 
615 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  47.25 
 
 
338 aa  220  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.73 
 
 
601 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  44.04 
 
 
626 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.84 
 
 
598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.12 
 
 
603 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 
691 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
703 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  37.82 
 
 
692 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  44.12 
 
 
612 aa  214  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.66 
 
 
627 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 
757 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.05 
 
 
681 aa  213  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.8 
 
 
676 aa  213  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  42.18 
 
 
691 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.54 
 
 
700 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.93 
 
 
579 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  40.74 
 
 
614 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  42.91 
 
 
604 aa  211  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  46.01 
 
 
758 aa  211  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  43.22 
 
 
609 aa  211  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  24.53 
 
 
664 aa  211  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  24.53 
 
 
664 aa  211  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  47.49 
 
 
503 aa  210  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.65 
 
 
602 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.48 
 
 
715 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  41.24 
 
 
666 aa  207  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.96 
 
 
613 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  42.22 
 
 
635 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.24 
 
 
668 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>