More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0048 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  84.62 
 
 
603 aa  935    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  100 
 
 
609 aa  1225    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  54.5 
 
 
613 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  50 
 
 
647 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  49.3 
 
 
676 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.33 
 
 
681 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  51.26 
 
 
582 aa  463  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  44.8 
 
 
615 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  47.47 
 
 
597 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.82 
 
 
664 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  45.09 
 
 
618 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  48.11 
 
 
625 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  47.35 
 
 
625 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  44.66 
 
 
668 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  45.09 
 
 
598 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.24 
 
 
613 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.47 
 
 
601 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  45.7 
 
 
626 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  46.96 
 
 
624 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  43.93 
 
 
691 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  46.96 
 
 
624 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  46.96 
 
 
624 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.92 
 
 
681 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  43.1 
 
 
661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  44.19 
 
 
635 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  42.72 
 
 
736 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.6 
 
 
693 aa  405  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  47.38 
 
 
668 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 
632 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 
691 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.57 
 
 
648 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.54 
 
 
594 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  65.72 
 
 
700 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  62.46 
 
 
700 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  40.14 
 
 
667 aa  368  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 
690 aa  356  7.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  59.62 
 
 
758 aa  335  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.83 
 
 
645 aa  335  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.42 
 
 
627 aa  320  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.41 
 
 
612 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  36.89 
 
 
625 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  33.63 
 
 
638 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.62 
 
 
668 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.78 
 
 
584 aa  310  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.07 
 
 
653 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.33 
 
 
579 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.12 
 
 
520 aa  300  4e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.79 
 
 
667 aa  299  9e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.4 
 
 
650 aa  299  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  36.59 
 
 
672 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  33.17 
 
 
656 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  37.25 
 
 
604 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  35.69 
 
 
692 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.47 
 
 
641 aa  291  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  32.32 
 
 
621 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.17 
 
 
657 aa  290  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 
657 aa  289  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.64 
 
 
627 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
651 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 
703 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 
657 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
657 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.75 
 
 
647 aa  287  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.18 
 
 
632 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.4 
 
 
658 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  32.59 
 
 
657 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.22 
 
 
598 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
657 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
657 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
657 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.3 
 
 
602 aa  283  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
657 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  35.31 
 
 
612 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.91 
 
 
692 aa  280  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
691 aa  279  9e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.88 
 
 
593 aa  279  9e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
657 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  52.75 
 
 
951 aa  276  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.4 
 
 
652 aa  274  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.4 
 
 
607 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.3 
 
 
591 aa  272  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  34.8 
 
 
642 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 
662 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 
646 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.94 
 
 
715 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
625 aa  266  7e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  36.23 
 
 
623 aa  266  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 
666 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.44 
 
 
702 aa  264  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30.69 
 
 
662 aa  258  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  32.68 
 
 
623 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4030  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.43 
 
 
445 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457727 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 
651 aa  248  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  31.5 
 
 
641 aa  247  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.21 
 
 
634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  33.45 
 
 
612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  29.64 
 
 
666 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.28 
 
 
562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  43.45 
 
 
776 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  47.55 
 
 
468 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>