135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26930  hypothetical protein  100 
 
 
754 aa  1429    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  42.41 
 
 
596 aa  132  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  37.83 
 
 
1652 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
622 aa  95.5  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37930  hypothetical protein  36.11 
 
 
612 aa  92.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  32.42 
 
 
498 aa  89  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  34.15 
 
 
505 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.77 
 
 
533 aa  81.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.9 
 
 
546 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9039  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 
594 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31870  hypothetical protein  32.41 
 
 
872 aa  76.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.37 
 
 
650 aa  69.3  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  31.96 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 
612 aa  66.6  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  42.41 
 
 
690 aa  65.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.04 
 
 
661 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
468 aa  64.3  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  34.51 
 
 
503 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
730 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
631 aa  62  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 
636 aa  61.2  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  29.47 
 
 
1217 aa  61.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
581 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  31.79 
 
 
532 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 
651 aa  59.7  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  25.82 
 
 
623 aa  59.7  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
705 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 
625 aa  58.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.54 
 
 
668 aa  58.9  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
559 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 
568 aa  58.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
450 aa  57.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  22.9 
 
 
662 aa  57  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 
403 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 
403 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 
405 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.29 
 
 
642 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  23.92 
 
 
614 aa  55.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  32.74 
 
 
623 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
503 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  28.49 
 
 
544 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
480 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  29.7 
 
 
477 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.37 
 
 
602 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2236  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.06 
 
 
535 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  31.1 
 
 
412 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.89 
 
 
707 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
522 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
776 aa  54.3  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.54 
 
 
653 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  23.3 
 
 
634 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  25.61 
 
 
796 aa  53.5  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  30.13 
 
 
493 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 
595 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  33.04 
 
 
1219 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 
557 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0454  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
464 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  31.74 
 
 
658 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
757 aa  53.5  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 
703 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 
610 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.01 
 
 
598 aa  52.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
581 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
513 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1908  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.8 
 
 
655 aa  52  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182347  hitchhiker  0.00089522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 
855 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
647 aa  51.6  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.74 
 
 
658 aa  51.6  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
585 aa  51.2  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 
542 aa  51.2  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
666 aa  50.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 
618 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
596 aa  50.8  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 
554 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
533 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  32.72 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
553 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  26.7 
 
 
736 aa  50.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
575 aa  50.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
721 aa  50.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0099  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
456 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  28.57 
 
 
790 aa  50.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  33.95 
 
 
534 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 
710 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4160  hypothetical protein  30.16 
 
 
539 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.819524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 
614 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.19 
 
 
591 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
646 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2528  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
266 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00115723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 
657 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 
646 aa  49.3  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  28 
 
 
469 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  26.67 
 
 
593 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2804  serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 
598 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 
657 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  21.86 
 
 
641 aa  48.9  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 
657 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 
657 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.36 
 
 
627 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>