More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2804 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2804  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 598 aa  1183    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  47.81 
 
 		 586 aa  425  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 824 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  27.26 
 
 		 790 aa  197  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 791 aa  177  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 790 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  31.09 
 
 		 582 aa  93.6  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  24.57 
 
 		 546 aa  93.6  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  27.27 
 
 		 480 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  25.29 
 
 		 612 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.2 
 
 		 627 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.18 
 
 		 668 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  23.31 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  30.19 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  29.6 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  22.22 
 
 		 664 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  22.22 
 
 		 664 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  22.87 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  28.62 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.79 
 
 		 707 aa  72.4  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  22.43 
 
 		 869 aa  70.5  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  22.9 
 
 		 612 aa  70.5  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.79 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  27.18 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  23.62 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 990 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  21.79 
 
 		 692 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 502 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25 
 
 		 650 aa  67.4  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3705  protein kinase  28.85 
 
 		 449 aa  67  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.424517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.63 
 
 		 406 aa  67  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.97 
 
 		 728 aa  66.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.22 
 
 		 863 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  28.1 
 
 		 951 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 414 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  21.88 
 
 		 691 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  28.03 
 
 		 414 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.09 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 624 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.74 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  25.27 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  30.8 
 
 		 1100 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 		 862 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.22 
 
 		 1072 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 710 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.08 
 
 		 715 aa  64.7  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.68 
 
 		 1072 aa  64.7  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  24.73 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.76 
 
 		 681 aa  63.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  20.22 
 
 		 638 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.92 
 
 		 603 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.28 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  23.62 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  26.72 
 
 		 658 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  27.97 
 
 		 1358 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.85 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 666 aa  61.6  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  20.68 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26.35 
 
 		 618 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  27.82 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.46 
 
 		 1267 aa  60.8  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.81 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  21.95 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.1 
 
 		 880 aa  60.5  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.41 
 
 		 614 aa  60.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 		 985 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 425 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.19 
 
 		 1076 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.16 
 
 		 613 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.34 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  20.6 
 
 		 641 aa  60.1  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  27.04 
 
 		 403 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1463  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.383152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  23.08 
 
 		 621 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 		 691 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  23.51 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>