187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5604 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  977    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  63.37 
 
 
477 aa  624  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  34.03 
 
 
488 aa  286  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  36.17 
 
 
485 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  35.02 
 
 
499 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  36.29 
 
 
484 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  35.25 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  36.08 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  36.08 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  36.29 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  35.4 
 
 
499 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  34.66 
 
 
485 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  34.58 
 
 
507 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  34.58 
 
 
507 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  34.13 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  34.26 
 
 
507 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  33.4 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
791 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
824 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  33.98 
 
 
790 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  30.11 
 
 
546 aa  124  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 
790 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  23.78 
 
 
491 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  23.57 
 
 
491 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  23.93 
 
 
491 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  23.81 
 
 
477 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  24.18 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  21.73 
 
 
488 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  22.1 
 
 
488 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  23.75 
 
 
466 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  21.86 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  22.08 
 
 
482 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2804  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
598 aa  80.1  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  23.47 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  21.43 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 
297 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  27.08 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  21.2 
 
 
491 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.74 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  21.5 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  28.23 
 
 
586 aa  73.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  26.79 
 
 
582 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  25.56 
 
 
280 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.09 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  23.94 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  27.87 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.34 
 
 
297 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  29.17 
 
 
284 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  21.71 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  22.02 
 
 
291 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  27.69 
 
 
275 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  22.02 
 
 
291 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  25.69 
 
 
279 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  26.55 
 
 
305 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  23.98 
 
 
280 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  24.85 
 
 
283 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  22.58 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  23.59 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  24.71 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  26.29 
 
 
280 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 
298 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 
285 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.39 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 
299 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  22.64 
 
 
297 aa  60.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  22.62 
 
 
281 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
284 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  23.96 
 
 
279 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.49 
 
 
505 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.41 
 
 
456 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.94 
 
 
287 aa  60.1  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  29.25 
 
 
289 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  24.35 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.16 
 
 
299 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.22 
 
 
634 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  24.49 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.48 
 
 
284 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.52 
 
 
280 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 
284 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
280 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
274 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
280 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  24.71 
 
 
292 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  25.31 
 
 
455 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
292 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  24.15 
 
 
476 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
274 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
274 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  20.9 
 
 
289 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  20.09 
 
 
486 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 
283 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  26.04 
 
 
273 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>