245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2062 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  100 
 
 		 480 aa  966    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  34.66 
 
 		 476 aa  262  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  34.8 
 
 		 477 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  32.99 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  31.73 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  31.6 
 
 		 494 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  30.94 
 
 		 493 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  30.67 
 
 		 489 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  32.64 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 491 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  29.98 
 
 		 484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  31.07 
 
 		 491 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  30.99 
 
 		 488 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  30.98 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  30.79 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  30.69 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  31.68 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  23.2 
 
 		 486 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  23.2 
 
 		 790 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  37.77 
 
 		 546 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 791 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  24.57 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  24.8 
 
 		 497 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 		 824 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 790 aa  96.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 		 283 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  31.22 
 
 		 280 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  27.48 
 
 		 582 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 284 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.79 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  29.56 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.73 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  30.41 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 285 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  27.08 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 286 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.11 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  30.84 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2804  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  25.86 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  22.7 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.32 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  26.48 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.85 
 
 		 287 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 297 aa  73.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 280 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  26.89 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.35 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  26.42 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  26.42 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  26.42 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.68 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  23.41 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  25.87 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  23.55 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  31.94 
 
 		 716 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.14 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.14 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  26.17 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  25.7 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  26.21 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.37 
 
 		 517 aa  67  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.9 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25 
 
 		 303 aa  67  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  25 
 
 		 485 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>