More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0195 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0195  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 595 aa  1175    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.7 
 
 		 529 aa  207  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  33.92 
 
 		 528 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  30.73 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  31.02 
 
 		 522 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 511 aa  177  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  31.71 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 498 aa  170  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  30.8 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  30.41 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  31.42 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.42 
 
 		 541 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  29.87 
 
 		 530 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.5 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  31.92 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29.86 
 
 		 521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 		 530 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  29.84 
 
 		 515 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.14 
 
 		 516 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 519 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  30.6 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  27.81 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  29.84 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 519 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  32.28 
 
 		 527 aa  160  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.23 
 
 		 519 aa  160  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  30.6 
 
 		 535 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  29.61 
 
 		 511 aa  160  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  27.85 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  29.76 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.09 
 
 		 505 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  32.03 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  28.45 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  29.05 
 
 		 539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 		 517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 519 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  32.43 
 
 		 511 aa  157  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 519 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 519 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 519 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  26.21 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  27.39 
 
 		 520 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.55 
 
 		 519 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  27.56 
 
 		 524 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 531 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 522 aa  154  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 		 573 aa  154  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  28.18 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 521 aa  153  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 519 aa  153  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  27.9 
 
 		 519 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  32.17 
 
 		 534 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 		 521 aa  151  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  28.45 
 
 		 519 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 		 522 aa  150  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  29.53 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.73 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  28.75 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  28.36 
 
 		 523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  26.75 
 
 		 534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 		 522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  28.14 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  34.3 
 
 		 536 aa  147  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  31.6 
 
 		 513 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 516 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  34.3 
 
 		 536 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  26.2 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  32.29 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  29.3 
 
 		 525 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  32.29 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  30.06 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  27.98 
 
 		 516 aa  144  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.26 
 
 		 518 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 508 aa  144  5e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 511 aa  144  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  30.11 
 
 		 495 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  27.41 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>