More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2006 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2006  group 1 glycosyl transferase  100 
 
 		 411 aa  761    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.669637  normal  0.233825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  59.11 
 
 		 378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  48.37 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3020  glycosyl transferase group 1  47.15 
 
 		 360 aa  226  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  43.66 
 
 		 386 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  43.12 
 
 		 357 aa  217  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  43.24 
 
 		 388 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2350  glycosyl transferase group 1  43.15 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169241  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3003  glycosyl transferase group 1  45.72 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  40.89 
 
 		 964 aa  183  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2176  glycosyl transferase group 1  63.37 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000383211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5412  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3142  glycosyl transferase group 1  51.82 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal  0.711865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  44.22 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.42 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  42.86 
 
 		 405 aa  86.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 364 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  43.36 
 
 		 750 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.57 
 
 		 745 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.65 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  38.55 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  42.76 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  44.57 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  35.15 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  39.57 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.17 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  39.43 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  40.29 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  38.69 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.59 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  38.82 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 		 1080 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  40.7 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4433  hypothetical protein  38.99 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.179213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  22.47 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>