More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0299 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0604  glycosyl transferase group 1  78.16 
 
 		 522 aa  881    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.175398  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0539  starch synthase  94.07 
 
 		 523 aa  1021    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0299  starch synthase  100 
 
 		 523 aa  1073    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1380  starch synthase  93.88 
 
 		 523 aa  1025    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0651235  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0007  glycosyl transferase group 1  58.1 
 
 		 526 aa  649    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.482024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.79 
 
 		 498 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  26.41 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  27.92 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  28.17 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  26.46 
 
 		 479 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  26.57 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.54 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  25.48 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  25.81 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.03 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.8 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.51 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.76 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  28.19 
 
 		 494 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  27.65 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  27.65 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.4 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.4 
 
 		 486 aa  147  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.21 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  26.1 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  24.51 
 
 		 483 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  25.32 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.3 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.07 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.07 
 
 		 497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.12 
 
 		 490 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.03 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  24.56 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  25.74 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.65 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  23.86 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  24.89 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.6 
 
 		 480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.9 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  24.51 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.23 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.26 
 
 		 488 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.86 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.99 
 
 		 493 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.29 
 
 		 488 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  22.96 
 
 		 487 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  22.96 
 
 		 487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.73 
 
 		 487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  23.29 
 
 		 511 aa  136  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  25.05 
 
 		 479 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  26.1 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.87 
 
 		 478 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.9 
 
 		 496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  26.01 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.57 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.72 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.68 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  24.42 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.69 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.54 
 
 		 485 aa  134  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  25.81 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.84 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  27.98 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  26.98 
 
 		 491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2742  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.79 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  25.05 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.77 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  24.49 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  26.82 
 
 		 476 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  26.25 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  26.87 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  25.81 
 
 		 492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  27.43 
 
 		 485 aa  130  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.9 
 
 		 489 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  26.81 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  26.81 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  27.18 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  26.1 
 
 		 476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  26.81 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  26.81 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.56 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  22.01 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  25.25 
 
 		 501 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  24.28 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  25.49 
 
 		 476 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  29.15 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.85 
 
 		 491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  23.43 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  23.47 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1988  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  25.22 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.983075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  26.01 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  24.61 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  25.66 
 
 		 519 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>