More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0726 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  100 
 
 		 492 aa  1007    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  54.79 
 
 		 476 aa  558  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  49.17 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  47.41 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  44.81 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  45.02 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  44.42 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.85 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  44.21 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  44.42 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  44.21 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  44.01 
 
 		 498 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  44.21 
 
 		 498 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  46.3 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  44.4 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  44.63 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.02 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  44.1 
 
 		 478 aa  408  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.18 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  44.33 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.77 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.24 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.06 
 
 		 488 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.59 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.53 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.78 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.38 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.96 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.08 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.22 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.2 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.22 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.09 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.56 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.7 
 
 		 487 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  42.65 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.92 
 
 		 478 aa  363  3e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.44 
 
 		 490 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.49 
 
 		 484 aa  358  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.74 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.6 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.51 
 
 		 518 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.53 
 
 		 475 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.53 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.98 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.98 
 
 		 494 aa  345  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.12 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.21 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.73 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.24 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  38.59 
 
 		 488 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.33 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.39 
 
 		 506 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.75 
 
 		 497 aa  338  9e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.07 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  38.16 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.96 
 
 		 463 aa  333  3e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.9 
 
 		 504 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.04 
 
 		 509 aa  329  7e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.68 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41777  predicted protein  35.67 
 
 		 525 aa  329  8e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112054  hitchhiker  0.00385989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  38.63 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  39.26 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.14 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.03 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  38.62 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  38.65 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.14 
 
 		 460 aa  319  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0239  glycogen synthase  37.55 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  38.45 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.92 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  37.24 
 
 		 474 aa  317  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  37.63 
 
 		 513 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.99 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  38.01 
 
 		 490 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.46 
 
 		 499 aa  312  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  36.4 
 
 		 486 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  36.69 
 
 		 487 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  36.69 
 
 		 487 aa  310  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  37.5 
 
 		 486 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  37.5 
 
 		 485 aa  309  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.81 
 
 		 448 aa  309  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.45 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.81 
 
 		 525 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  37.1 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.91 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01576  glycogen synthase  37.5 
 
 		 486 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.78 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  38.11 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  37.89 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.96 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.2 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.29 
 
 		 480 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.48 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.73 
 
 		 477 aa  300  6e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  37.65 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.66 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.58 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>