More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1322 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  64.77 
 
 
497 aa  692    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  67.96 
 
 
496 aa  706    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
500 aa  1039    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  58.81 
 
 
487 aa  601  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  56.17 
 
 
488 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.28 
 
 
490 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.98 
 
 
480 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.5 
 
 
587 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  50.61 
 
 
480 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.47 
 
 
482 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.17 
 
 
481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.17 
 
 
486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.17 
 
 
486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.67 
 
 
481 aa  463  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.4 
 
 
478 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.16 
 
 
485 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  47.6 
 
 
485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.12 
 
 
486 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.92 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.37 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  46 
 
 
477 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  45.05 
 
 
480 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  45.05 
 
 
498 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  46.96 
 
 
484 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  45.45 
 
 
498 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  45.23 
 
 
476 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  45.44 
 
 
476 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  44.96 
 
 
480 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  45.03 
 
 
476 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  45.05 
 
 
498 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  45.05 
 
 
498 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  44.65 
 
 
480 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  45.44 
 
 
478 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  45.23 
 
 
478 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  45.12 
 
 
484 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.64 
 
 
475 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.84 
 
 
475 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.56 
 
 
477 aa  415  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.81 
 
 
484 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  44.31 
 
 
484 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.2 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.43 
 
 
477 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.57 
 
 
502 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.91 
 
 
473 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.12 
 
 
467 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  42.57 
 
 
501 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.67 
 
 
518 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.1 
 
 
483 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.76 
 
 
475 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.83 
 
 
491 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.78 
 
 
478 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  43.95 
 
 
493 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  40.16 
 
 
476 aa  376  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.21 
 
 
488 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.07 
 
 
534 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.85 
 
 
499 aa  373  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.19 
 
 
509 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.85 
 
 
494 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.59 
 
 
504 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.37 
 
 
463 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.56 
 
 
496 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.6 
 
 
506 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  39.96 
 
 
492 aa  361  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.65 
 
 
491 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.48 
 
 
503 aa  360  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.48 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.53 
 
 
499 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.32 
 
 
485 aa  353  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.92 
 
 
488 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  39.63 
 
 
477 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.46 
 
 
488 aa  351  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 
491 aa  350  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  40.66 
 
 
465 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.28 
 
 
481 aa  349  6e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.23 
 
 
483 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.57 
 
 
491 aa  346  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.28 
 
 
498 aa  343  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.12 
 
 
482 aa  342  8e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.03 
 
 
497 aa  342  9e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  38.41 
 
 
477 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.7 
 
 
489 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  38.41 
 
 
477 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  39.06 
 
 
472 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.31 
 
 
482 aa  341  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.72 
 
 
487 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  38.82 
 
 
460 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  38.2 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  38.34 
 
 
469 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2803  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.51 
 
 
500 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0129152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.17 
 
 
493 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.07 
 
 
493 aa  333  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  38.52 
 
 
491 aa  332  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.88 
 
 
489 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  41.88 
 
 
489 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  38.1 
 
 
479 aa  330  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.33 
 
 
460 aa  330  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.92 
 
 
477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  38.88 
 
 
484 aa  326  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.65 
 
 
485 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  39.31 
 
 
482 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>