More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0555 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  100 
 
 
478 aa  990    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  52.52 
 
 
480 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  51.79 
 
 
485 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  53.68 
 
 
482 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  51.46 
 
 
498 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  51.67 
 
 
476 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  51.88 
 
 
476 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  51.67 
 
 
480 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  51.25 
 
 
480 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  51.25 
 
 
476 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  51.25 
 
 
498 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  51.25 
 
 
498 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  51.46 
 
 
498 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  51.79 
 
 
480 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  50.84 
 
 
478 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  50.63 
 
 
480 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  51.47 
 
 
477 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.73 
 
 
481 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.22 
 
 
467 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.64 
 
 
478 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.21 
 
 
477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.95 
 
 
587 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.98 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.27 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  43.7 
 
 
476 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.93 
 
 
496 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.66 
 
 
488 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.23 
 
 
500 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.96 
 
 
491 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.69 
 
 
486 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.69 
 
 
486 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.88 
 
 
496 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  44.1 
 
 
492 aa  408  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.53 
 
 
487 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.58 
 
 
481 aa  396  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.06 
 
 
497 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.29 
 
 
484 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.96 
 
 
484 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.47 
 
 
486 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39.96 
 
 
484 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.26 
 
 
486 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.83 
 
 
473 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.47 
 
 
485 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.42 
 
 
484 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.37 
 
 
484 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.58 
 
 
490 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.15 
 
 
497 aa  362  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.15 
 
 
482 aa  353  4e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.67 
 
 
488 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.46 
 
 
483 aa  345  8e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.32 
 
 
491 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.05 
 
 
475 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.26 
 
 
493 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.94 
 
 
506 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.48 
 
 
494 aa  342  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.1 
 
 
504 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.42 
 
 
475 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.67 
 
 
518 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.29 
 
 
475 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.04 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.89 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  39.63 
 
 
513 aa  336  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.92 
 
 
509 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  39.71 
 
 
477 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  38.67 
 
 
501 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.14 
 
 
502 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  38.17 
 
 
477 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  38.17 
 
 
477 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  39.67 
 
 
469 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.84 
 
 
534 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  38.78 
 
 
460 aa  329  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.76 
 
 
493 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  39.17 
 
 
465 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.92 
 
 
491 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.63 
 
 
493 aa  324  2e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.18 
 
 
482 aa  323  4e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  38.8 
 
 
472 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  36.53 
 
 
486 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.42 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  37.4 
 
 
511 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  37.97 
 
 
499 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  38.11 
 
 
487 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  38.11 
 
 
487 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.52 
 
 
491 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.46 
 
 
477 aa  317  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.04 
 
 
488 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.11 
 
 
483 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  38.8 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.26 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.27 
 
 
488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  37.55 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  39.05 
 
 
488 aa  312  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 
489 aa  312  9e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.71 
 
 
496 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.56 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  35.9 
 
 
486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  39.01 
 
 
485 aa  306  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.8 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.91 
 
 
507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  36.59 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>