More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06940 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
587 aa  1214    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  56.18 
 
 
480 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  54.39 
 
 
481 aa  546  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  50.73 
 
 
485 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  52.53 
 
 
480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  51.95 
 
 
488 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.59 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.37 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  50.62 
 
 
487 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  49.16 
 
 
480 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  48.54 
 
 
498 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  48.54 
 
 
498 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.5 
 
 
500 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  48.54 
 
 
498 aa  485  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  48.54 
 
 
498 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.99 
 
 
497 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  48.33 
 
 
480 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  49.16 
 
 
476 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  48.73 
 
 
476 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  48.73 
 
 
476 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  51.14 
 
 
473 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  48.74 
 
 
480 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.98 
 
 
496 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  48.74 
 
 
478 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.54 
 
 
467 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  45.68 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  49.37 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  46.95 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.39 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.8 
 
 
478 aa  445  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.27 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.27 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.11 
 
 
477 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.19 
 
 
499 aa  426  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.95 
 
 
496 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.58 
 
 
484 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  43 
 
 
484 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.68 
 
 
481 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.68 
 
 
491 aa  425  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.14 
 
 
485 aa  415  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.62 
 
 
463 aa  415  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  43.24 
 
 
492 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.56 
 
 
484 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.89 
 
 
486 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.89 
 
 
486 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  41.27 
 
 
484 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.04 
 
 
475 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.89 
 
 
502 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.81 
 
 
483 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  41.08 
 
 
484 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.36 
 
 
475 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.36 
 
 
475 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  41.1 
 
 
477 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  41.74 
 
 
465 aa  357  5e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  41.1 
 
 
477 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  39.39 
 
 
501 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  39.76 
 
 
469 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.77 
 
 
488 aa  353  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.35 
 
 
518 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  40.46 
 
 
460 aa  351  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.56 
 
 
477 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.26 
 
 
491 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.29 
 
 
488 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.35 
 
 
494 aa  351  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  36.55 
 
 
513 aa  350  5e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.59 
 
 
534 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  39.13 
 
 
511 aa  349  7e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.99 
 
 
506 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.08 
 
 
497 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.35 
 
 
460 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  40.95 
 
 
493 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.15 
 
 
509 aa  342  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  38.93 
 
 
479 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  38.78 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  38.78 
 
 
487 aa  339  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  38.8 
 
 
477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  39.55 
 
 
488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.15 
 
 
504 aa  336  7e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  39.2 
 
 
472 aa  336  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.55 
 
 
499 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  38.16 
 
 
490 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.97 
 
 
485 aa  333  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  37.68 
 
 
499 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.51 
 
 
491 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  39.55 
 
 
474 aa  330  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  37.94 
 
 
476 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.1 
 
 
507 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  38.78 
 
 
483 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.57 
 
 
503 aa  330  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.2 
 
 
489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  38.36 
 
 
483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  38.57 
 
 
483 aa  326  6e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.34 
 
 
482 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.06 
 
 
493 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.37 
 
 
483 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2377  glycogen synthase  36.96 
 
 
489 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.698809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  39.67 
 
 
484 aa  321  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.97 
 
 
491 aa  319  7.999999999999999e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.47 
 
 
481 aa  319  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.19 
 
 
493 aa  317  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>