More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1521 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  100 
 
 
481 aa  987    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  49.58 
 
 
485 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.84 
 
 
476 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  47.82 
 
 
499 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  49.69 
 
 
486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  49.48 
 
 
486 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  49.48 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  49.38 
 
 
477 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  50.1 
 
 
477 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  49.38 
 
 
477 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  49.38 
 
 
477 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  49.38 
 
 
477 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  50.31 
 
 
477 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  49.38 
 
 
477 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  49.79 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  49.79 
 
 
479 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  49.28 
 
 
556 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  49.48 
 
 
477 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  48.46 
 
 
478 aa  435  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.06 
 
 
496 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  48.34 
 
 
477 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  48.54 
 
 
477 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.19 
 
 
485 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.89 
 
 
498 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  46.97 
 
 
482 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  45.83 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  47.81 
 
 
479 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  47.25 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  46.86 
 
 
483 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  47.3 
 
 
476 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  45.88 
 
 
486 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.61 
 
 
491 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  46.76 
 
 
482 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.31 
 
 
494 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  47.1 
 
 
476 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  47.1 
 
 
476 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.29 
 
 
549 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  45.72 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.84 
 
 
489 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  46.84 
 
 
489 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  47.5 
 
 
489 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  45.13 
 
 
501 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.98 
 
 
488 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  43.78 
 
 
480 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  45.74 
 
 
479 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.3 
 
 
489 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.79 
 
 
483 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  47.63 
 
 
494 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.04 
 
 
491 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.49 
 
 
491 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  46.12 
 
 
483 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  43.15 
 
 
480 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  45.93 
 
 
488 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  44.33 
 
 
543 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  44.33 
 
 
543 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.15 
 
 
485 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  45.57 
 
 
483 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4426  glycogen synthase  48.13 
 
 
467 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  43.1 
 
 
478 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.36 
 
 
508 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.06 
 
 
495 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.16 
 
 
478 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  44.96 
 
 
478 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  43.93 
 
 
484 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  43.5 
 
 
544 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  45.51 
 
 
512 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  42.06 
 
 
486 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  43.93 
 
 
484 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  43.75 
 
 
528 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  44.54 
 
 
513 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  45.17 
 
 
509 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  44.51 
 
 
510 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  44.42 
 
 
532 aa  360  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.67 
 
 
475 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  44.42 
 
 
510 aa  359  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  43.53 
 
 
533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.56 
 
 
475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  44.28 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  42.83 
 
 
541 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.26 
 
 
480 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  42.92 
 
 
529 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  43.1 
 
 
515 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  42.89 
 
 
513 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.28 
 
 
500 aa  349  5e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.97 
 
 
494 aa  349  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  42.01 
 
 
484 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  42.27 
 
 
513 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  43.01 
 
 
519 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  43.01 
 
 
519 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  42.17 
 
 
532 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  43.01 
 
 
519 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  41.54 
 
 
484 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  43.01 
 
 
519 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>