More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1476 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  100 
 
 		 493 aa  999    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  55.69 
 
 		 483 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  52.98 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  52.24 
 
 		 498 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.21 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  52.39 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.49 
 
 		 489 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.76 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.37 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.57 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  51.12 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  51.12 
 
 		 489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  46.78 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  53.32 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.92 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  46.38 
 
 		 486 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  46.91 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  47.18 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.83 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  46.76 
 
 		 482 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  49.06 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  47.72 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  46.85 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  48.45 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  49.18 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  46.25 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  46.8 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  46.35 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  46.17 
 
 		 486 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.37 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  48.48 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.98 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.18 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.11 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.97 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  46.8 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  45.85 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  46.44 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  45.61 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  46.44 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  46.44 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  46.44 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  46.44 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.64 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.79 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  46.54 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.12 
 
 		 486 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  44.86 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  46.22 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.64 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  44.98 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.92 
 
 		 486 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  45.07 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  44.81 
 
 		 480 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  45.8 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.25 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  46.04 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  44.86 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  43.52 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  45.07 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  45.07 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.73 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1104  glycogen synthase  51.45 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.95 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  46.67 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.63 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  44.05 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.23 
 
 		 495 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.6 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  45.34 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.09 
 
 		 496 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.63 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  42.97 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.19 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.97 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  43.2 
 
 		 484 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.13 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.31 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.81 
 
 		 480 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.47 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  45.59 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  41.84 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.83 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  41.84 
 
 		 543 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  41.47 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  42.42 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  42.42 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 482 aa  363  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.97 
 
 		 485 aa  362  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.95 
 
 		 587 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.49 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  40.2 
 
 		 491 aa  359  6e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>