More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1241 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
476 aa  986    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.84 
 
 
481 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.26 
 
 
485 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.45 
 
 
491 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  45.55 
 
 
477 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  42.27 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  44.83 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  44.93 
 
 
477 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  46.42 
 
 
476 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  45.13 
 
 
479 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  45.13 
 
 
479 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.91 
 
 
499 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  46.42 
 
 
476 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  45.14 
 
 
477 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  46.01 
 
 
476 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  44.93 
 
 
477 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  42.15 
 
 
486 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  42.62 
 
 
480 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  45.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  44.72 
 
 
477 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.71 
 
 
485 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  44.72 
 
 
477 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  41.74 
 
 
486 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  44.72 
 
 
478 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.38 
 
 
488 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  44.72 
 
 
477 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  44.72 
 
 
477 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  44.72 
 
 
477 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.36 
 
 
483 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  43.63 
 
 
493 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  43.62 
 
 
487 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.8 
 
 
491 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.04 
 
 
494 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  44.3 
 
 
513 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.12 
 
 
496 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  40.33 
 
 
480 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.98 
 
 
498 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  44.09 
 
 
509 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.48 
 
 
491 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.8 
 
 
549 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  39.21 
 
 
480 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  40.37 
 
 
556 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  42.53 
 
 
482 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  42.83 
 
 
483 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  43.36 
 
 
482 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  40.66 
 
 
478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  43.42 
 
 
512 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  38.27 
 
 
501 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.78 
 
 
508 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  42.77 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  40.83 
 
 
484 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  40.83 
 
 
484 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  40.93 
 
 
544 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.8 
 
 
494 aa  353  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  42.8 
 
 
532 aa  352  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  42.8 
 
 
510 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  43.01 
 
 
510 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  39.83 
 
 
479 aa  350  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.36 
 
 
489 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  41.36 
 
 
489 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  42 
 
 
489 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  40.42 
 
 
478 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  41.86 
 
 
483 aa  345  7e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  40.77 
 
 
533 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  40.57 
 
 
529 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  42.32 
 
 
483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.08 
 
 
488 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.16 
 
 
496 aa  342  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.88 
 
 
485 aa  342  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.29 
 
 
484 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  41.7 
 
 
488 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  39.13 
 
 
543 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  39.13 
 
 
543 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  41.46 
 
 
472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.26 
 
 
493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  40.38 
 
 
515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.22 
 
 
475 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.65 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.22 
 
 
484 aa  336  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.82 
 
 
475 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  39.42 
 
 
513 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.06 
 
 
495 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.24 
 
 
486 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.56 
 
 
475 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  39.42 
 
 
513 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  39.09 
 
 
509 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  37.55 
 
 
486 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  37.97 
 
 
484 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.74 
 
 
484 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4426  glycogen synthase  40.99 
 
 
467 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  39.42 
 
 
519 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  39.21 
 
 
519 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  39.21 
 
 
519 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>