More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1279 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  93.57 
 
 		 533 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  100 
 
 		 529 aa  1064    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  71.62 
 
 		 544 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  53.74 
 
 		 543 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  53.74 
 
 		 543 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  55.08 
 
 		 541 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  52.55 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.9 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  43.32 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  43.33 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.42 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  43.12 
 
 		 477 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  43.57 
 
 		 487 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  43.17 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.03 
 
 		 485 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.05 
 
 		 494 aa  363  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  42.71 
 
 		 477 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  44.29 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  43.88 
 
 		 489 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  43.33 
 
 		 478 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  42.71 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.12 
 
 		 481 aa  360  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  42.22 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  42.92 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  42.92 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  42.92 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  42.51 
 
 		 479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  42.92 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  42.92 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  42.42 
 
 		 486 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  43.94 
 
 		 477 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  42.09 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.45 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  42.83 
 
 		 486 aa  352  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.77 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.65 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  43.35 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  41.24 
 
 		 493 aa  349  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  40.57 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.51 
 
 		 483 aa  346  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  42.59 
 
 		 484 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  42.59 
 
 		 484 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  42.01 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.98 
 
 		 488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  42.71 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.04 
 
 		 496 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  42.71 
 
 		 476 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  42.71 
 
 		 476 aa  340  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  42.74 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  40.64 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  42.39 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  41.92 
 
 		 479 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.32 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  40.08 
 
 		 480 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  40.25 
 
 		 480 aa  330  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  40.53 
 
 		 484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  39.84 
 
 		 484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  42.86 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.99 
 
 		 485 aa  326  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.56 
 
 		 486 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.24 
 
 		 488 aa  325  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  41.68 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.08 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.51 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.64 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.16 
 
 		 486 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.1 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  40.73 
 
 		 532 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  41.43 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.98 
 
 		 480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.19 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  40.25 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  40.72 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.06 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  41.01 
 
 		 488 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.45 
 
 		 509 aa  316  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.58 
 
 		 475 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  40 
 
 		 513 aa  316  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  40.89 
 
 		 515 aa  316  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  42.92 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.29 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  38.85 
 
 		 486 aa  313  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.2 
 
 		 489 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.2 
 
 		 489 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.63 
 
 		 484 aa  312  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  42.22 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4426  glycogen synthase  43.8 
 
 		 467 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.53 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.75 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  39.71 
 
 		 528 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.62 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.22 
 
 		 475 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.95 
 
 		 488 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>