More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2664 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 		 480 aa  985    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.79 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  43.81 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.79 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  40.38 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.86 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.75 
 
 		 475 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.75 
 
 		 475 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.79 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  40.16 
 
 		 491 aa  359  5e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.83 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.75 
 
 		 477 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  40.7 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  38.35 
 
 		 488 aa  353  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  40.9 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.71 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.46 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.8 
 
 		 508 aa  346  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  39.96 
 
 		 486 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.33 
 
 		 518 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.85 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  42.15 
 
 		 486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.05 
 
 		 493 aa  339  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  42.16 
 
 		 487 aa  339  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.67 
 
 		 488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.38 
 
 		 481 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.68 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  41.14 
 
 		 556 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  37.19 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.12 
 
 		 534 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.81 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.22 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  40.77 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.26 
 
 		 491 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  36.21 
 
 		 498 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  36.63 
 
 		 476 aa  329  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.2 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.2 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  36.65 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  39.63 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  36.42 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  36.63 
 
 		 480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  36.42 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  36.42 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  36.42 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  36.21 
 
 		 480 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.76 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.26 
 
 		 478 aa  326  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  39.92 
 
 		 512 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  38.27 
 
 		 489 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  36.21 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.53 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.88 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  37.16 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  39.38 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  38.19 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  39.11 
 
 		 533 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.29 
 
 		 486 aa  323  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.29 
 
 		 486 aa  323  5e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.27 
 
 		 487 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.73 
 
 		 502 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.43 
 
 		 487 aa  322  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.72 
 
 		 485 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  39.54 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.93 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.04 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.49 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.92 
 
 		 485 aa  320  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.4 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  36.04 
 
 		 476 aa  320  3e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.65 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  39.18 
 
 		 513 aa  320  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  39.21 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.48 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.32 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  37.98 
 
 		 529 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  38.14 
 
 		 480 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  36.96 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.29 
 
 		 504 aa  316  8e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.79 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.8 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.38 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  36.96 
 
 		 476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  41.2 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  35.39 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  37.32 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  37.42 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  38.8 
 
 		 532 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  36.2 
 
 		 482 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  38.8 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.53 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  38.59 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  38.38 
 
 		 484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.93 
 
 		 488 aa  306  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.05 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  39.14 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>