More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3078 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  100 
 
 		 509 aa  1025    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  90.84 
 
 		 513 aa  930    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  73.69 
 
 		 512 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  71.86 
 
 		 510 aa  712    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  72.67 
 
 		 510 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  72.1 
 
 		 532 aa  713    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  64.99 
 
 		 515 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2800  glycogen synthase  61.81 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  56.09 
 
 		 484 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  56.07 
 
 		 513 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  53.85 
 
 		 513 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  54.89 
 
 		 532 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  57.11 
 
 		 519 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  56.9 
 
 		 519 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  57.11 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  56.12 
 
 		 528 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  56.37 
 
 		 519 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  54.44 
 
 		 508 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  54.71 
 
 		 497 aa  511  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  54.94 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.11 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  45.28 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  46.33 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  46.33 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  44.65 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  44.65 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  44.65 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  45.83 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  44.44 
 
 		 479 aa  389  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.84 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  44.73 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  46.12 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  44.65 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  44.65 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  44.03 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  47.11 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  43.61 
 
 		 477 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  44.03 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  44.44 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  44.03 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.09 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.15 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  45.95 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  46.07 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  43.89 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.33 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.67 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.11 
 
 		 485 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.17 
 
 		 481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  45.74 
 
 		 486 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  41.26 
 
 		 479 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.26 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  41.2 
 
 		 480 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  41.2 
 
 		 480 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.72 
 
 		 489 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  41.6 
 
 		 493 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  43.86 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  40.87 
 
 		 478 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.65 
 
 		 491 aa  347  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  42.71 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.58 
 
 		 475 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.68 
 
 		 498 aa  340  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  42.41 
 
 		 482 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  41.48 
 
 		 486 aa  339  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.65 
 
 		 508 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.03 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  42.65 
 
 		 472 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.18 
 
 		 495 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.76 
 
 		 475 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  43.09 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  42.02 
 
 		 483 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  42.43 
 
 		 482 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.14 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  43.88 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  41.93 
 
 		 479 aa  325  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.92 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.88 
 
 		 480 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.58 
 
 		 484 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.34 
 
 		 486 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.04 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.44 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  41.44 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  43.27 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  41.13 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  41.13 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.13 
 
 		 485 aa  317  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.4 
 
 		 475 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  39.43 
 
 		 544 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.4 
 
 		 500 aa  315  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  40.25 
 
 		 533 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.23 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  41.34 
 
 		 478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.74 
 
 		 496 aa  312  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>