More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0412 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 		 495 aa  991    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  61.91 
 
 		 486 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  56.24 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  56.65 
 
 		 486 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  58.98 
 
 		 487 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  55.42 
 
 		 486 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  54.25 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  53.25 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  53.25 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  51.84 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  53.13 
 
 		 478 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  53.58 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  52.85 
 
 		 476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  53.78 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  53.37 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  53.37 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  53.37 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  53.37 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  53.37 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  51.53 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  50.71 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  49.59 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  49.8 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  48.26 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.14 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.83 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  47.75 
 
 		 489 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  47.24 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  47.23 
 
 		 483 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  50.99 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.84 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  46.01 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  45.18 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  46.54 
 
 		 488 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  46.52 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  42.91 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  42.51 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.06 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.93 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.3 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  42.97 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.8 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.25 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.47 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.79 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  42.59 
 
 		 501 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  46.42 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  45.7 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  45.29 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  45.29 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.18 
 
 		 489 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  42.57 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  45.05 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4426  glycogen synthase  46.09 
 
 		 467 aa  362  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  44.24 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  45.29 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  44.24 
 
 		 510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.92 
 
 		 485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.03 
 
 		 485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.21 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.74 
 
 		 508 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  43.81 
 
 		 497 aa  349  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  43.46 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.46 
 
 		 489 aa  348  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  44.11 
 
 		 512 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  41.25 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.52 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  43.18 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.06 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  41.85 
 
 		 532 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  40.41 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  43.6 
 
 		 515 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  43.64 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  43.65 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  42.57 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  40.52 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  41.94 
 
 		 543 aa  336  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  41.94 
 
 		 543 aa  336  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  40.36 
 
 		 484 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  42.83 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  42.42 
 
 		 519 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  42.42 
 
 		 519 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  41.57 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.63 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  42.22 
 
 		 519 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.06 
 
 		 475 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.63 
 
 		 486 aa  329  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  38.34 
 
 		 491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  38.23 
 
 		 476 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  37.83 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.8 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  37.63 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>