More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0940 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  100 
 
 
556 aa  1107    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  51.7 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  51.25 
 
 
533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  49.59 
 
 
543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  49.59 
 
 
543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  49.28 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  48.32 
 
 
544 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.19 
 
 
499 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.42 
 
 
483 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  46.35 
 
 
493 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  47.19 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.4 
 
 
496 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.64 
 
 
491 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  49.59 
 
 
494 aa  412  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  49.07 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  49.09 
 
 
486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.66 
 
 
485 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  47.82 
 
 
482 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  47.53 
 
 
483 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  49.08 
 
 
477 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  45.81 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  48.12 
 
 
482 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.09 
 
 
549 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  48.25 
 
 
477 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  47.24 
 
 
487 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.36 
 
 
498 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  46.53 
 
 
486 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  46.12 
 
 
486 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  47.64 
 
 
479 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.35 
 
 
491 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.6 
 
 
485 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  46.61 
 
 
479 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.99 
 
 
488 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  45 
 
 
489 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  46.63 
 
 
477 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  46.63 
 
 
477 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  46.63 
 
 
477 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  46.63 
 
 
477 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  46.83 
 
 
477 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.58 
 
 
489 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45 
 
 
489 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  46.63 
 
 
477 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  46.2 
 
 
477 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  44.79 
 
 
489 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  45.68 
 
 
478 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  44.04 
 
 
501 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  47.13 
 
 
477 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.93 
 
 
488 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.06 
 
 
491 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.91 
 
 
508 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.37 
 
 
476 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  44.74 
 
 
479 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.95 
 
 
485 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  45.88 
 
 
476 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  45.88 
 
 
476 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  42.53 
 
 
486 aa  363  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  45.68 
 
 
476 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  41.75 
 
 
479 aa  361  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  43.58 
 
 
483 aa  360  5e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.42 
 
 
495 aa  359  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.83 
 
 
488 aa  359  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.08 
 
 
494 aa  352  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  40.98 
 
 
480 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  40.49 
 
 
480 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  43.65 
 
 
528 aa  349  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.72 
 
 
486 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  40.87 
 
 
480 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  43.69 
 
 
484 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  43.06 
 
 
488 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  43.69 
 
 
484 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.2 
 
 
486 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  45.15 
 
 
483 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  41.78 
 
 
484 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  40.61 
 
 
484 aa  339  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.24 
 
 
475 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  42.42 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  40.78 
 
 
519 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  43.65 
 
 
478 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  40.78 
 
 
519 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  41.01 
 
 
532 aa  336  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.14 
 
 
480 aa  336  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  42.94 
 
 
484 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  40.59 
 
 
519 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  41.49 
 
 
478 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.6 
 
 
484 aa  332  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  43.09 
 
 
509 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.6 
 
 
509 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  40.12 
 
 
519 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1104  glycogen synthase  46.3 
 
 
477 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.13 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.6 
 
 
475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40 
 
 
504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  39.22 
 
 
484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>