More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0242 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  100 
 
 		 541 aa  1083    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  72.93 
 
 		 543 aa  754    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  72.93 
 
 		 543 aa  754    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  55.08 
 
 		 529 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  51.65 
 
 		 544 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  51.85 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  49.07 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.56 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.44 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.51 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  44.56 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  42.83 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.63 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.64 
 
 		 498 aa  362  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  45.13 
 
 		 483 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  43.04 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.55 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  44.99 
 
 		 487 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  42.27 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  44.05 
 
 		 478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  42.95 
 
 		 477 aa  352  7e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  43.24 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  42.41 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  42.41 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  42.41 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  42.41 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  42.41 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  42.41 
 
 		 479 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  43.76 
 
 		 486 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.68 
 
 		 549 aa  349  6e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  41.44 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  42.41 
 
 		 478 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  42 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  42 
 
 		 479 aa  347  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.41 
 
 		 491 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  42.65 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  41.91 
 
 		 480 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  41.79 
 
 		 477 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  41.37 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  42.24 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  41.79 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  44.72 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  43.97 
 
 		 486 aa  336  7e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  38.05 
 
 		 479 aa  336  7e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  43.87 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  43.69 
 
 		 483 aa  335  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.59 
 
 		 496 aa  332  8e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.92 
 
 		 485 aa  332  8e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.2 
 
 		 508 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  41.37 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  41.58 
 
 		 476 aa  332  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.7 
 
 		 489 aa  331  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  41.58 
 
 		 476 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.15 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.86 
 
 		 485 aa  326  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.85 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  42.44 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.38 
 
 		 491 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.89 
 
 		 488 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.04 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  44.58 
 
 		 472 aa  318  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  42.59 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  41.72 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  42.59 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.45 
 
 		 489 aa  312  9e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.45 
 
 		 489 aa  312  9e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.47 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.86 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.02 
 
 		 476 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  41.21 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  42.12 
 
 		 483 aa  306  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.67 
 
 		 477 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  40.79 
 
 		 513 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.38 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  42.08 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.39 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  39.71 
 
 		 512 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.31 
 
 		 495 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.5 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  39.47 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  39.23 
 
 		 515 aa  296  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.55 
 
 		 487 aa  296  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  38.28 
 
 		 532 aa  296  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  38.96 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.87 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  34.15 
 
 		 476 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  37.4 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  38.28 
 
 		 510 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  34.08 
 
 		 498 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  34.29 
 
 		 498 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  34.15 
 
 		 476 aa  293  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  34.08 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>