More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1104 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1104  glycogen synthase  100 
 
 		 477 aa  945    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.310281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  68.67 
 
 		 483 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  51.67 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  52.43 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.17 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  52.26 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  51.66 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50 
 
 		 498 aa  418  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  47.39 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.76 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.76 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  46.03 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  47.3 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.45 
 
 		 508 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.45 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  46.82 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.82 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  46.3 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.99 
 
 		 491 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  44.89 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  46.83 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  44.21 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  43.22 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  46.14 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  46.04 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.83 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  46.14 
 
 		 476 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  43.42 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  45.93 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  42.27 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  44.35 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.06 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  43.12 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  44.79 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  42.71 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  46.15 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  43.42 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.75 
 
 		 476 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  43.42 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  43.42 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  43.42 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  43.42 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.44 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  43.22 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  44.26 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  44.74 
 
 		 512 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  43.6 
 
 		 486 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.44 
 
 		 475 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.46 
 
 		 488 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  43.48 
 
 		 486 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  44.68 
 
 		 489 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  45.3 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  40.54 
 
 		 480 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  42.8 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.62 
 
 		 494 aa  358  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  42.17 
 
 		 477 aa  358  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.38 
 
 		 494 aa  358  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.89 
 
 		 484 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  44.33 
 
 		 509 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.31 
 
 		 486 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  39.92 
 
 		 480 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  43.74 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.9 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  41.08 
 
 		 501 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.66 
 
 		 477 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.86 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  41.63 
 
 		 486 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  39.51 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  39.3 
 
 		 476 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  39.51 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.79 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  39.51 
 
 		 476 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  44.07 
 
 		 510 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.67 
 
 		 484 aa  342  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  39.51 
 
 		 476 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.21 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.56 
 
 		 480 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  39.58 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  44.54 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  39.51 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  39.75 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  39.51 
 
 		 480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  39.3 
 
 		 498 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  39.3 
 
 		 498 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  42.29 
 
 		 479 aa  339  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  43.01 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  43.01 
 
 		 510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.52 
 
 		 495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  39.5 
 
 		 484 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.12 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  39.92 
 
 		 532 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  40.96 
 
 		 528 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>