More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2302 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  95.88 
 
 		 510 aa  997    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  76.84 
 
 		 512 aa  755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  73.73 
 
 		 509 aa  708    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  75.21 
 
 		 513 aa  726    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  99.41 
 
 		 532 aa  1028    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  100 
 
 		 510 aa  1036    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  63.33 
 
 		 515 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  55.81 
 
 		 532 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  55.17 
 
 		 484 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2800  glycogen synthase  59.2 
 
 		 457 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  56.03 
 
 		 519 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3649  glycogen synthase  55.51 
 
 		 519 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0827399  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4050  glycogen synthase  55.82 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1793  glycogen synthase  55.3 
 
 		 519 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.834326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  54.09 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  52.75 
 
 		 528 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  54.47 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  53.31 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  53.05 
 
 		 508 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03376  glycogen synthase  55.05 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  48.65 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  44.44 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  44.65 
 
 		 478 aa  399  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  44.86 
 
 		 477 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  44.23 
 
 		 476 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  46.15 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  44.23 
 
 		 476 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  43.82 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  47.19 
 
 		 486 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  43.61 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.01 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  42.59 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  43.19 
 
 		 477 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  41.96 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  43.19 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.64 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  42.35 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.72 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  42.53 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.47 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  44.03 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.36 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  42.13 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  43.3 
 
 		 487 aa  362  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  44.7 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.42 
 
 		 481 aa  359  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.8 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.36 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.24 
 
 		 495 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  40.13 
 
 		 480 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.66 
 
 		 494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  40.5 
 
 		 489 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.58 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  39.79 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  40.3 
 
 		 482 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  43.07 
 
 		 479 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  40.96 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  41.84 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.03 
 
 		 491 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.18 
 
 		 508 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.63 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.82 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  39.92 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.45 
 
 		 475 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  40.25 
 
 		 486 aa  322  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.44 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  40.51 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.01 
 
 		 488 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  41.2 
 
 		 472 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  42.94 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.54 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  40.79 
 
 		 556 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.89 
 
 		 486 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.62 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.25 
 
 		 484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 		 486 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.32 
 
 		 494 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.74 
 
 		 475 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.28 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.28 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.9 
 
 		 497 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.45 
 
 		 488 aa  309  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.8 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  37.61 
 
 		 543 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  37.61 
 
 		 543 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.39 
 
 		 500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  38.64 
 
 		 484 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.43 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>