More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3652 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  67.64 
 
 		 478 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  100 
 
 		 480 aa  986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  66.67 
 
 		 480 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  96.04 
 
 		 480 aa  952    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  57.32 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4276  glycogen synthase  54.17 
 
 		 486 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  54.68 
 
 		 485 aa  521  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  51.67 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  50.73 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  50.52 
 
 		 482 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  49.48 
 
 		 482 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  48.85 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  50.31 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.64 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  50.73 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  49.69 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  51.36 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  49.69 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  48.86 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  46.03 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  45.21 
 
 		 479 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  44.58 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.24 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  45.21 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.28 
 
 		 485 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  44.98 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  44.98 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4426  glycogen synthase  47.27 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  44.77 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  45.85 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  44.56 
 
 		 476 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  44.35 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  43.85 
 
 		 486 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  42.95 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.27 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  43.62 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  43.62 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.78 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  44.56 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.53 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.56 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.57 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.53 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.91 
 
 		 495 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  42.21 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.32 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.49 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.21 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  40.41 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.98 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  41.89 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.89 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  41.2 
 
 		 509 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  41.2 
 
 		 513 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.56 
 
 		 491 aa  352  8e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 491 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.25 
 
 		 489 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  40.98 
 
 		 556 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  40.53 
 
 		 513 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  39.75 
 
 		 484 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  40.12 
 
 		 543 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  40.12 
 
 		 543 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  39.96 
 
 		 532 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  38.52 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  39.71 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  38.32 
 
 		 498 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  41.37 
 
 		 483 aa  340  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  38.32 
 
 		 498 aa  339  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  42.27 
 
 		 541 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  39.79 
 
 		 532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  40.25 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  38.11 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  38.11 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  38.11 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  38.11 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  40 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  39.79 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  38.11 
 
 		 498 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  38.11 
 
 		 498 aa  336  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  38.11 
 
 		 476 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.68 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.02 
 
 		 488 aa  334  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  36.99 
 
 		 485 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.5 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  38.76 
 
 		 515 aa  326  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  38.9 
 
 		 544 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1824  glycogen synthase  40.74 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142099  normal  0.142129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>