More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5336 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  100 
 
 		 544 aa  1105    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  74.4 
 
 		 529 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  71.8 
 
 		 533 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  54.09 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  54.09 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0242  glycogen synthase  51.65 
 
 		 541 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000133222  normal  0.110435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  48.59 
 
 		 556 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.8 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.5 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1465  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.87 
 
 		 549 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  43.72 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  43.32 
 
 		 489 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  41.16 
 
 		 486 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  43.23 
 
 		 483 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.93 
 
 		 476 aa  353  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.52 
 
 		 494 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.95 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  41.68 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  42.57 
 
 		 478 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  42.36 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  42.48 
 
 		 477 aa  349  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  41.96 
 
 		 477 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  41.55 
 
 		 477 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  41.6 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  43 
 
 		 482 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  40.68 
 
 		 486 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  40.94 
 
 		 477 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.48 
 
 		 491 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.59 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  41.75 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  41.75 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  41.75 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  41.75 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  41.75 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  42.48 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  41.34 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  40.78 
 
 		 493 aa  336  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  40.53 
 
 		 479 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  40.33 
 
 		 479 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  40.76 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.73 
 
 		 488 aa  333  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.05 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2885  glycogen synthase  41.51 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.890574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1531  glycogen synthase  41.51 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.292938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4003  glycogen synthase  41.55 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4121  glycogen synthase  41.55 
 
 		 476 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  40.82 
 
 		 478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0150  glycogen synthase  41.55 
 
 		 476 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.56 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  39.55 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.02 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  38.9 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0213  glycogen synthase  39.68 
 
 		 483 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  38.77 
 
 		 484 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36570  glycogen synthase  41.98 
 
 		 513 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000975999  normal  0.942766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3125  glycogen synthase  40.28 
 
 		 484 aa  323  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.13 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  38.01 
 
 		 479 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3141  glycogen synthase  41.4 
 
 		 513 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2992  glycogen synthase  40.28 
 
 		 532 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.61 
 
 		 489 aa  317  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.61 
 
 		 489 aa  317  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  39.43 
 
 		 509 aa  316  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1135  glycogen synthase  40.49 
 
 		 478 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  39.19 
 
 		 513 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  40.89 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.65 
 
 		 491 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  42.02 
 
 		 483 aa  312  7.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.57 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.66 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.82 
 
 		 488 aa  310  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2549  glycogen synthase  40.4 
 
 		 528 aa  309  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.3 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1656  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.31 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1107  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.73 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.686449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.51 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.85 
 
 		 486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.65 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  40.56 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24910  glycogen synthase  40.28 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  36.93 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.4 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  38.27 
 
 		 532 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.51 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2277  glycogen synthase  39.92 
 
 		 508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.100037  hitchhiker  0.00503982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3115  glycogen synthase  40.62 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  38.27 
 
 		 510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41 
 
 		 475 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.53 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.63 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  38.27 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.8 
 
 		 475 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>