More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0153 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
477 aa  948    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  95.79 
 
 
475 aa  887    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  76.79 
 
 
475 aa  704    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  97.47 
 
 
475 aa  902    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.64 
 
 
487 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  49.9 
 
 
484 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  46.85 
 
 
484 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.43 
 
 
500 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  50.21 
 
 
493 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.44 
 
 
486 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.9 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.42 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  47 
 
 
484 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.69 
 
 
494 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.65 
 
 
486 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.33 
 
 
480 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.41 
 
 
480 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.15 
 
 
478 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.41 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.47 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.03 
 
 
491 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  45.21 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.8 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.8 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.32 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.17 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.38 
 
 
497 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  40.71 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  46.78 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.82 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  48.36 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.3 
 
 
481 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.15 
 
 
507 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.38 
 
 
502 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.25 
 
 
489 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  48.25 
 
 
489 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.17 
 
 
509 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.03 
 
 
484 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  40.29 
 
 
480 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.51 
 
 
482 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  40.29 
 
 
476 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.36 
 
 
506 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  43.01 
 
 
485 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.27 
 
 
518 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.96 
 
 
504 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  40.08 
 
 
498 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  40.29 
 
 
498 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.48 
 
 
489 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  39.87 
 
 
476 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  40.08 
 
 
476 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  39.87 
 
 
498 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  39.67 
 
 
480 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  40.08 
 
 
498 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.21 
 
 
485 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.13 
 
 
488 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  39.87 
 
 
480 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.91 
 
 
499 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.45 
 
 
499 aa  376  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.56 
 
 
587 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.27 
 
 
534 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  45.27 
 
 
486 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.56 
 
 
481 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  47.67 
 
 
487 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.19 
 
 
488 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.48 
 
 
493 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.35 
 
 
496 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  45.19 
 
 
486 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.06 
 
 
460 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  44.99 
 
 
486 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  39.67 
 
 
478 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  40.37 
 
 
476 aa  365  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  47.97 
 
 
486 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.76 
 
 
483 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.05 
 
 
525 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.75 
 
 
480 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.7 
 
 
497 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.68 
 
 
487 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.46 
 
 
482 aa  364  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  40.73 
 
 
492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.9 
 
 
498 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  40.29 
 
 
488 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.14 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.84 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  37.89 
 
 
478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.17 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  49.38 
 
 
483 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.92 
 
 
489 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  44.56 
 
 
483 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.74 
 
 
485 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.4 
 
 
473 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.4 
 
 
485 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.82 
 
 
476 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  43.71 
 
 
479 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  40.97 
 
 
474 aa  346  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  40.88 
 
 
476 aa  346  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  38.76 
 
 
491 aa  345  8e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.95 
 
 
491 aa  345  8e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.25 
 
 
478 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0923  glycogen synthase  43.83 
 
 
488 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.704278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  42.95 
 
 
489 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>