More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1386 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 		 477 aa  973    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  41.82 
 
 		 484 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.83 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.13 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.66 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.25 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.41 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.5 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.51 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.68 
 
 		 481 aa  347  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  38.08 
 
 		 484 aa  347  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.87 
 
 		 487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  40.5 
 
 		 476 aa  343  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  40.29 
 
 		 476 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  40.08 
 
 		 498 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.88 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  40.29 
 
 		 480 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.41 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  39.87 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.2 
 
 		 486 aa  340  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.11 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.2 
 
 		 486 aa  340  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  39.87 
 
 		 498 aa  339  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  39.87 
 
 		 498 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.65 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  39.87 
 
 		 476 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  39.67 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.72 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  39.67 
 
 		 480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.46 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  38.33 
 
 		 485 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.27 
 
 		 475 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.42 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.09 
 
 		 473 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.92 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.26 
 
 		 497 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.83 
 
 		 497 aa  325  8.000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.17 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.58 
 
 		 477 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.92 
 
 		 483 aa  320  1.9999999999999998e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.4 
 
 		 476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.36 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  39.25 
 
 		 478 aa  319  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.48 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.81 
 
 		 489 aa  317  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  39.46 
 
 		 478 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.08 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.7 
 
 		 481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.91 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.64 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.27 
 
 		 491 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.85 
 
 		 494 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.07 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.49 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.51 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.42 
 
 		 502 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.44 
 
 		 487 aa  310  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.07 
 
 		 534 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.2 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.49 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  38.12 
 
 		 477 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.9 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  36.65 
 
 		 480 aa  303  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.73 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  36.36 
 
 		 480 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  35.49 
 
 		 501 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.11 
 
 		 488 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2803  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.06 
 
 		 500 aa  302  9e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0129152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.45 
 
 		 507 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.67 
 
 		 488 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  34.01 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.63 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  36.07 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.17 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  38.05 
 
 		 447 aa  299  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.83 
 
 		 490 aa  300  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  37.73 
 
 		 492 aa  300  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  34.85 
 
 		 477 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  34.82 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.95 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.79 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.8 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  34.42 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  36.61 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  34.53 
 
 		 512 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  34.83 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  34.83 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  34.83 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  34.83 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.21 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>