More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3035 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  100 
 
 		 488 aa  1016    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  52.27 
 
 		 484 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0239  glycogen synthase  52.5 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  52.59 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01576  glycogen synthase  51.45 
 
 		 486 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  49.49 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  48.55 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.86 
 
 		 502 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.41 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.7 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.33 
 
 		 487 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.68 
 
 		 534 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.27 
 
 		 518 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.81 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.5 
 
 		 475 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.85 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  39.71 
 
 		 501 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.53 
 
 		 486 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.93 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.56 
 
 		 497 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.35 
 
 		 480 aa  353  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.08 
 
 		 484 aa  353  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.75 
 
 		 475 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 486 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  37.79 
 
 		 484 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.78 
 
 		 507 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  38.76 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.12 
 
 		 480 aa  349  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.63 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.41 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  38.89 
 
 		 480 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 477 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  38.32 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.84 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  39.17 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  38.59 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  38.64 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  38.32 
 
 		 480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.68 
 
 		 499 aa  339  5.9999999999999996e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.96 
 
 		 484 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.6 
 
 		 497 aa  339  8e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.17 
 
 		 482 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  38.43 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.2 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  38.64 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.55 
 
 		 587 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.71 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  38.22 
 
 		 476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  37.45 
 
 		 476 aa  336  5e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  38.46 
 
 		 498 aa  336  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  38.35 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  38.51 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.15 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.66 
 
 		 488 aa  333  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  39.06 
 
 		 477 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 491 aa  329  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.3 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.11 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.96 
 
 		 490 aa  326  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.26 
 
 		 525 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.03 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.9 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  37.97 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  37.94 
 
 		 486 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  36.46 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  39.05 
 
 		 478 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.01 
 
 		 478 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  37.09 
 
 		 486 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.86 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.86 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.5 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.17 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  37.17 
 
 		 489 aa  310  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.48 
 
 		 481 aa  309  9e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.34 
 
 		 499 aa  309  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.19 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.53 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.59 
 
 		 491 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.78 
 
 		 488 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  35.95 
 
 		 486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41777  predicted protein  35.33 
 
 		 525 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112054  hitchhiker  0.00385989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.59 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.73 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.64 
 
 		 494 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.99 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.91 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.32 
 
 		 482 aa  299  8e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.12 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.92 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.97 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.7 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.88 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.37 
 
 		 491 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  35.94 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.34 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.79 
 
 		 485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.76 
 
 		 508 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.54 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  35.67 
 
 		 487 aa  286  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>