More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1839 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
503 aa  1045    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.3 
 
 
481 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.92 
 
 
497 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.22 
 
 
486 aa  361  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.99 
 
 
507 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.22 
 
 
486 aa  361  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.48 
 
 
500 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.33 
 
 
487 aa  355  7.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  38.33 
 
 
485 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.35 
 
 
480 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.4 
 
 
486 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.61 
 
 
486 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.34 
 
 
488 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.52 
 
 
496 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.67 
 
 
478 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.31 
 
 
494 aa  342  7e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.16 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.7 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.08 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.37 
 
 
484 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  37.37 
 
 
498 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39.22 
 
 
484 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  37.3 
 
 
480 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  37.32 
 
 
476 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.39 
 
 
504 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  37.37 
 
 
498 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  37.37 
 
 
498 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.27 
 
 
485 aa  334  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  37.4 
 
 
498 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  37.17 
 
 
480 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.3 
 
 
506 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.04 
 
 
475 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.04 
 
 
475 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  38.01 
 
 
501 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.57 
 
 
587 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  37.11 
 
 
476 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  36.96 
 
 
480 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.37 
 
 
509 aa  329  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  37.11 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.3 
 
 
460 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.76 
 
 
490 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.25 
 
 
477 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.44 
 
 
481 aa  324  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.17 
 
 
482 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  36.63 
 
 
478 aa  320  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.01 
 
 
484 aa  319  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.88 
 
 
483 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.78 
 
 
534 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  34.86 
 
 
477 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  35.44 
 
 
476 aa  317  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.73 
 
 
502 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  35.98 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  36.61 
 
 
465 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  37.25 
 
 
493 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.12 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  35.08 
 
 
477 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  35.08 
 
 
477 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  36.59 
 
 
477 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.33 
 
 
467 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  36.03 
 
 
476 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.32 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  36.53 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.92 
 
 
518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.93 
 
 
499 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  37.14 
 
 
499 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.94 
 
 
496 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  35.04 
 
 
487 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  35.04 
 
 
487 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.17 
 
 
473 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  34.3 
 
 
472 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  34.42 
 
 
460 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  33.8 
 
 
479 aa  297  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.47 
 
 
497 aa  297  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.01 
 
 
488 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.1 
 
 
477 aa  295  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.27 
 
 
499 aa  295  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.42 
 
 
483 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.65 
 
 
481 aa  294  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  36.63 
 
 
490 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.74 
 
 
525 aa  293  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  33.74 
 
 
492 aa  293  7e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.58 
 
 
463 aa  292  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.4 
 
 
494 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  36.76 
 
 
511 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  38.99 
 
 
486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  37.27 
 
 
484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2377  glycogen synthase  31.59 
 
 
489 aa  289  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.698809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  34.16 
 
 
478 aa  289  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  38.59 
 
 
486 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.95 
 
 
493 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  38.52 
 
 
486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  36.99 
 
 
556 aa  287  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  34.75 
 
 
491 aa  286  5.999999999999999e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  36.97 
 
 
513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  34.87 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.83 
 
 
482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.61 
 
 
485 aa  282  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.5 
 
 
477 aa  282  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.27 
 
 
491 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  36.57 
 
 
486 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>