More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0004 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
482 aa  1000    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39.22 
 
 
484 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  41.19 
 
 
484 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.77 
 
 
484 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.12 
 
 
486 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.43 
 
 
484 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.12 
 
 
486 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.82 
 
 
480 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  38.59 
 
 
484 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.7 
 
 
478 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.63 
 
 
486 aa  353  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.63 
 
 
486 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  41.15 
 
 
478 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.89 
 
 
488 aa  353  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.58 
 
 
480 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.65 
 
 
488 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 
477 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.18 
 
 
483 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.83 
 
 
494 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.58 
 
 
485 aa  341  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.31 
 
 
500 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  39.75 
 
 
485 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.74 
 
 
482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.84 
 
 
487 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.35 
 
 
477 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.84 
 
 
475 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.55 
 
 
490 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 
481 aa  333  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.54 
 
 
497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.43 
 
 
496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  40.7 
 
 
480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.08 
 
 
481 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  40.7 
 
 
476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  40.49 
 
 
476 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.34 
 
 
587 aa  325  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.51 
 
 
504 aa  325  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  40.29 
 
 
498 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  40.29 
 
 
498 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  40.29 
 
 
498 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  40.12 
 
 
478 aa  323  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  40.37 
 
 
498 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.98 
 
 
496 aa  322  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.09 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  40.2 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  36.44 
 
 
501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  40.08 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  40.2 
 
 
476 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.37 
 
 
499 aa  317  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.11 
 
 
475 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.11 
 
 
475 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.31 
 
 
489 aa  316  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  38.21 
 
 
477 aa  316  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.53 
 
 
491 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.27 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  37.4 
 
 
491 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.02 
 
 
518 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  37.76 
 
 
477 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.29 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.78 
 
 
488 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.98 
 
 
499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.4 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.52 
 
 
506 aa  306  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  37.29 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  37.29 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  35.77 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.99 
 
 
496 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.53 
 
 
473 aa  303  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.51 
 
 
487 aa  302  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.77 
 
 
485 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.29 
 
 
534 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.08 
 
 
467 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  35.82 
 
 
476 aa  300  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  37.96 
 
 
492 aa  300  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  36.25 
 
 
460 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.83 
 
 
491 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.68 
 
 
525 aa  299  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.89 
 
 
478 aa  299  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  36.2 
 
 
493 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3652  glycogen synthase  35.56 
 
 
480 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.577848 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.49 
 
 
480 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  35.62 
 
 
479 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.15 
 
 
481 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  35.1 
 
 
501 aa  295  9e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  35.64 
 
 
480 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  34.49 
 
 
486 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0412  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.67 
 
 
495 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.724768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.2 
 
 
497 aa  294  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  36.04 
 
 
472 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.03 
 
 
483 aa  293  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.6 
 
 
494 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  34.27 
 
 
478 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2803  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.03 
 
 
500 aa  292  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0129152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.16 
 
 
493 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  36.1 
 
 
465 aa  291  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.4 
 
 
493 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  35.42 
 
 
469 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.92 
 
 
489 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.31 
 
 
485 aa  290  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.29 
 
 
508 aa  289  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.11 
 
 
507 aa  289  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>