More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1331 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  76.88 
 
 		 487 aa  810    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  61.44 
 
 		 472 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  100 
 
 		 513 aa  1064    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  88.28 
 
 		 511 aa  949    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  75.99 
 
 		 483 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  66.52 
 
 		 465 aa  655    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  63.4 
 
 		 469 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  78.91 
 
 		 490 aa  816    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  75.78 
 
 		 483 aa  793    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  75.78 
 
 		 483 aa  794    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  75.16 
 
 		 483 aa  786    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  76.6 
 
 		 487 aa  813    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  80.75 
 
 		 499 aa  839    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  59.87 
 
 		 479 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  63.6 
 
 		 477 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  60.35 
 
 		 460 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  59.43 
 
 		 477 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  59.43 
 
 		 477 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.32 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.55 
 
 		 587 aa  350  5e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  42.44 
 
 		 485 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.26 
 
 		 478 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  39.55 
 
 		 486 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  39.5 
 
 		 476 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  39.5 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  39.29 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  39.5 
 
 		 476 aa  340  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  39.09 
 
 		 480 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  39.25 
 
 		 498 aa  339  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  39.29 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  39.09 
 
 		 498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  38.88 
 
 		 498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  39.63 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.04 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.04 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  39.29 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.35 
 
 		 487 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.42 
 
 		 480 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.51 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  38.01 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  39.14 
 
 		 484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.22 
 
 		 475 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  38.85 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  40.45 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  38.82 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.9 
 
 		 475 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.96 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.16 
 
 		 475 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.02 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.63 
 
 		 489 aa  323  5e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.19 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.5 
 
 		 497 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.1 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.98 
 
 		 494 aa  318  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.89 
 
 		 500 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.12 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.97 
 
 		 484 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  37.63 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.68 
 
 		 485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39.31 
 
 		 484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.16 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.41 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.68 
 
 		 491 aa  313  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.67 
 
 		 499 aa  312  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.49 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.55 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.91 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  36.95 
 
 		 478 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  37.76 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.65 
 
 		 489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.92 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.76 
 
 		 502 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.17 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  38.16 
 
 		 486 aa  306  8.000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.55 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.63 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.06 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.46 
 
 		 504 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.81 
 
 		 485 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.49 
 
 		 484 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.66 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.76 
 
 		 493 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  37.55 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.76 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  37.87 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  37.45 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.31 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.82 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.25 
 
 		 496 aa  300  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  38.8 
 
 		 556 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.49 
 
 		 491 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.19 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  37.45 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.36 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.31 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  35.23 
 
 		 491 aa  296  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.53 
 
 		 486 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  37.86 
 
 		 501 aa  297  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.17 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.94 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>