More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0781 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
463 aa  947    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  57.88 
 
 
473 aa  537  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.62 
 
 
587 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  44.26 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  46.64 
 
 
480 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.05 
 
 
480 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.56 
 
 
488 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  43.49 
 
 
476 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  43.07 
 
 
498 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  43.07 
 
 
498 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  43.28 
 
 
476 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.39 
 
 
481 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  43.28 
 
 
476 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  43.07 
 
 
498 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  43.07 
 
 
480 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  43.07 
 
 
498 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  43.49 
 
 
480 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  42.86 
 
 
480 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.24 
 
 
482 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.89 
 
 
487 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.12 
 
 
486 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.12 
 
 
486 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.37 
 
 
500 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.14 
 
 
467 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.56 
 
 
477 aa  360  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.98 
 
 
497 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  41.89 
 
 
478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  39.24 
 
 
476 aa  354  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.18 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.3 
 
 
478 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.83 
 
 
497 aa  347  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  41.39 
 
 
477 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.2 
 
 
499 aa  345  1e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.62 
 
 
490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.91 
 
 
481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  41.04 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.21 
 
 
496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.86 
 
 
485 aa  335  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  40.96 
 
 
492 aa  333  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  37.19 
 
 
484 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.76 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.25 
 
 
484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  35.83 
 
 
484 aa  322  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.39 
 
 
475 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.47 
 
 
475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.59 
 
 
509 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.25 
 
 
486 aa  316  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.29 
 
 
502 aa  315  9e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.61 
 
 
475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.59 
 
 
504 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  37.42 
 
 
501 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  38.2 
 
 
460 aa  312  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 
491 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.62 
 
 
486 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.08 
 
 
483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  38.28 
 
 
472 aa  310  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.97 
 
 
496 aa  309  6.999999999999999e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.51 
 
 
518 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  34.85 
 
 
484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  37.66 
 
 
477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  37.66 
 
 
477 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  36.92 
 
 
465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  37.87 
 
 
469 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.82 
 
 
477 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  36.97 
 
 
479 aa  300  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  37.55 
 
 
477 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.8 
 
 
477 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.05 
 
 
506 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.27 
 
 
534 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  35.28 
 
 
487 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  35.28 
 
 
487 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.64 
 
 
507 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  34.42 
 
 
511 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  34.42 
 
 
513 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  33.77 
 
 
499 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.58 
 
 
503 aa  292  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  35.34 
 
 
488 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41777  predicted protein  33.27 
 
 
525 aa  290  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112054  hitchhiker  0.00385989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.4 
 
 
493 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  35.91 
 
 
483 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  35.7 
 
 
483 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  35.48 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.4 
 
 
460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2742  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 
473 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341368  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  35.05 
 
 
491 aa  280  6e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.38 
 
 
493 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  35.62 
 
 
483 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  33.69 
 
 
490 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  35.11 
 
 
493 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.89 
 
 
489 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.45 
 
 
483 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.68 
 
 
487 aa  276  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.81 
 
 
488 aa  276  8e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.71 
 
 
491 aa  273  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.83 
 
 
482 aa  272  8.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  34.31 
 
 
474 aa  272  9e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.26 
 
 
488 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  31.82 
 
 
556 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.38 
 
 
494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.61 
 
 
488 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>