More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4775 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  81.48 
 
 
469 aa  821    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  100 
 
 
472 aa  989    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  61.44 
 
 
513 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  60.59 
 
 
511 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  74.67 
 
 
465 aa  759    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  72.36 
 
 
477 aa  746    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  74.51 
 
 
477 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  78 
 
 
460 aa  789    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  72.36 
 
 
477 aa  746    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  87.74 
 
 
479 aa  902    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  60.57 
 
 
499 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  59.4 
 
 
490 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  58.67 
 
 
487 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  61.22 
 
 
483 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  58.89 
 
 
487 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  60.35 
 
 
483 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  60.78 
 
 
483 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  60.13 
 
 
483 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.5 
 
 
486 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.5 
 
 
486 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.09 
 
 
478 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.06 
 
 
500 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.75 
 
 
487 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.62 
 
 
488 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  39.87 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.67 
 
 
480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.2 
 
 
587 aa  336  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.8 
 
 
480 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  39.38 
 
 
485 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  39.34 
 
 
476 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  39.5 
 
 
484 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  39.13 
 
 
476 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  38.72 
 
 
480 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  38.92 
 
 
480 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.92 
 
 
496 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  38.72 
 
 
476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  38.84 
 
 
498 aa  328  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  38.72 
 
 
498 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  38.51 
 
 
498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  38.72 
 
 
476 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  38.51 
 
 
480 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  38.3 
 
 
498 aa  326  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.55 
 
 
485 aa  324  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.42 
 
 
484 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  38.8 
 
 
478 aa  323  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  38.46 
 
 
477 aa  323  6e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.67 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.96 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.5 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.16 
 
 
481 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.11 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.73 
 
 
484 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.02 
 
 
506 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.72 
 
 
497 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.7 
 
 
478 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.49 
 
 
483 aa  316  7e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.89 
 
 
467 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.21 
 
 
475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  36.83 
 
 
486 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  37.47 
 
 
478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.3 
 
 
460 aa  310  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.28 
 
 
463 aa  310  5e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.55 
 
 
491 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38 
 
 
491 aa  309  5.9999999999999995e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.21 
 
 
475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.48 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.4 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.87 
 
 
481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  37.37 
 
 
487 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.87 
 
 
491 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  37.11 
 
 
556 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.08 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36 
 
 
490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.92 
 
 
498 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  39.01 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.83 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.01 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.95 
 
 
499 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  38.11 
 
 
492 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.69 
 
 
489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.37 
 
 
494 aa  303  6.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.55 
 
 
491 aa  302  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.61 
 
 
485 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.3 
 
 
503 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0957  glycogen synthase  40.08 
 
 
483 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220032  normal  0.273541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.44 
 
 
481 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.31 
 
 
476 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.87 
 
 
477 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  34.97 
 
 
491 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.9 
 
 
477 aa  296  6e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.96 
 
 
518 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  37.45 
 
 
482 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.08 
 
 
486 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.04 
 
 
482 aa  294  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.06 
 
 
534 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0386  glycogen synthase  37.14 
 
 
483 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.07 
 
 
507 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.88 
 
 
486 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  36.53 
 
 
484 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.21 
 
 
488 aa  292  9e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>