More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0082 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  100 
 
 		 477 aa  983    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  54.41 
 
 		 485 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  54.95 
 
 		 480 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  52.52 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  52.73 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  52.73 
 
 		 476 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  51.68 
 
 		 476 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  51.68 
 
 		 498 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  51.89 
 
 		 498 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  51.68 
 
 		 498 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  51.68 
 
 		 476 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  51.47 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  51.68 
 
 		 498 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  51.47 
 
 		 478 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.84 
 
 		 482 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  51.47 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  51.05 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.42 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.06 
 
 		 481 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  47.58 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  50.32 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.37 
 
 		 587 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.64 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  49.48 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  48.78 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.7 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.7 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  49.17 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.53 
 
 		 497 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  44.81 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  46.53 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.31 
 
 		 496 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  43.45 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  43.4 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.38 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.47 
 
 		 490 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.89 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.89 
 
 		 484 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.89 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.76 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.71 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.5 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  42.17 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.48 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.08 
 
 		 486 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.17 
 
 		 475 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.08 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.71 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.18 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.05 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.33 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.21 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.31 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.54 
 
 		 460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  39.59 
 
 		 501 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.18 
 
 		 518 aa  349  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.39 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.34 
 
 		 509 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 504 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.13 
 
 		 497 aa  341  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.14 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.67 
 
 		 483 aa  338  9e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.55 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.24 
 
 		 489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40 
 
 		 482 aa  336  5e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.59 
 
 		 488 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.53 
 
 		 507 aa  335  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  40.58 
 
 		 465 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.91 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.85 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  39.06 
 
 		 488 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  39.54 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  38.41 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  38.7 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.7 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.55 
 
 		 488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.26 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  38.99 
 
 		 477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  38.99 
 
 		 477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.57 
 
 		 485 aa  325  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  37.63 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.76 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  38.71 
 
 		 493 aa  323  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  38.46 
 
 		 472 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  38.16 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.47 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41777  predicted protein  36.89 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112054  hitchhiker  0.00385989 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  38.17 
 
 		 479 aa  318  9e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.86 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.17 
 
 		 489 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2377  glycogen synthase  35.58 
 
 		 489 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.698809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.85 
 
 		 488 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  38.38 
 
 		 487 aa  316  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.21 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  38.38 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.93 
 
 		 496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  37.07 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0344  glycogen synthase  37.14 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0441  glycogen synthase  37.96 
 
 		 482 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>