More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6185 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
525 aa  1068    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.14 
 
 
507 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.05 
 
 
506 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  43.02 
 
 
501 aa  428  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.27 
 
 
534 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.69 
 
 
518 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.56 
 
 
502 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.23 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.12 
 
 
504 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.03 
 
 
475 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  45.26 
 
 
475 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.05 
 
 
475 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  41.22 
 
 
484 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  38.11 
 
 
491 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.81 
 
 
497 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.77 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.38 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.92 
 
 
488 aa  356  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.15 
 
 
484 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.25 
 
 
477 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.46 
 
 
486 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.27 
 
 
486 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.61 
 
 
493 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.76 
 
 
486 aa  347  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.76 
 
 
486 aa  347  4e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.58 
 
 
488 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.49 
 
 
491 aa  340  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.05 
 
 
487 aa  339  9e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.23 
 
 
484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.6 
 
 
483 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  38.13 
 
 
476 aa  334  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  40.65 
 
 
493 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  36.26 
 
 
488 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.45 
 
 
478 aa  332  1e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.9 
 
 
485 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.72 
 
 
480 aa  330  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.99 
 
 
488 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.55 
 
 
496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.54 
 
 
489 aa  322  8e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.06 
 
 
500 aa  322  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  38.54 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  34.56 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  40.15 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.31 
 
 
499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.56 
 
 
481 aa  318  1e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40 
 
 
508 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.46 
 
 
485 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.01 
 
 
480 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  36.76 
 
 
485 aa  317  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.88 
 
 
482 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  34.87 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  35.33 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  35.14 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.65 
 
 
482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.62 
 
 
496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.66 
 
 
497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01576  glycogen synthase  36.52 
 
 
486 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  34.69 
 
 
476 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.69 
 
 
481 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40 
 
 
488 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  34.94 
 
 
498 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  34.94 
 
 
498 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  34.94 
 
 
480 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  34.94 
 
 
498 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  35.99 
 
 
485 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  35.27 
 
 
476 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.62 
 
 
460 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  34.88 
 
 
476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  36.38 
 
 
484 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  39.38 
 
 
486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  37.79 
 
 
480 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.04 
 
 
481 aa  309  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  38.61 
 
 
486 aa  309  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  36.33 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1596  glycogen synthase  39.33 
 
 
512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.92 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.06 
 
 
485 aa  307  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  34.68 
 
 
480 aa  307  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.68 
 
 
482 aa  307  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.53 
 
 
478 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.26 
 
 
503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  35.47 
 
 
477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  38.95 
 
 
486 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2025  glycogen synthase  38.99 
 
 
532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3078  glycogen synthase  38.99 
 
 
509 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  37.93 
 
 
479 aa  302  8.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2302  glycogen synthase  38.99 
 
 
510 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1987  glycogen synthase  39.18 
 
 
510 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.78 
 
 
493 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.12 
 
 
487 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.21 
 
 
489 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0155  glycogen synthase  39.02 
 
 
515 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  38.07 
 
 
501 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.78 
 
 
587 aa  300  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5269  glycogen synthase  39.18 
 
 
513 aa  300  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  38.8 
 
 
486 aa  299  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  37.11 
 
 
465 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.31 
 
 
488 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  35.98 
 
 
477 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3350  glycogen synthase  37.31 
 
 
480 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>