More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0106 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 		 493 aa  1022    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  62.92 
 
 		 488 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  61.97 
 
 		 487 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  60.95 
 
 		 488 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  59.87 
 
 		 489 aa  601  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.77 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.35 
 
 		 475 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.79 
 
 		 486 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.45 
 
 		 486 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.08 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.15 
 
 		 475 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.89 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  41.05 
 
 		 484 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.61 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.92 
 
 		 480 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  40.21 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.75 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.75 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.57 
 
 		 477 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.94 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.28 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.79 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.71 
 
 		 494 aa  343  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.05 
 
 		 480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.26 
 
 		 476 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.78 
 
 		 484 aa  339  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  39.33 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  37.71 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.2 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  39.09 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.1 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.84 
 
 		 482 aa  333  4e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.07 
 
 		 500 aa  333  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  37.78 
 
 		 480 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.74 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.33 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  37.76 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.67 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  37.37 
 
 		 498 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  37.37 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.85 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  39.26 
 
 		 486 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  38.81 
 
 		 501 aa  326  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.3 
 
 		 502 aa  326  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  37.58 
 
 		 498 aa  325  9e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.39 
 
 		 491 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  37.37 
 
 		 476 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  39.26 
 
 		 484 aa  325  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  38.22 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.98 
 
 		 478 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  39.34 
 
 		 486 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  36.78 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.37 
 
 		 489 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.51 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.37 
 
 		 489 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  37.37 
 
 		 498 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  36.76 
 
 		 476 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.61 
 
 		 477 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.9 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.83 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  36.96 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  38.85 
 
 		 486 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.85 
 
 		 493 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.44 
 
 		 498 aa  318  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.19 
 
 		 587 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.78 
 
 		 518 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  36.42 
 
 		 480 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  39.3 
 
 		 477 aa  316  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.87 
 
 		 481 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.61 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  35.89 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.51 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  39.43 
 
 		 477 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.52 
 
 		 534 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.64 
 
 		 477 aa  313  5.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  38.16 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  38.16 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  38.16 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  38.24 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  38.16 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  38.16 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  38.24 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.76 
 
 		 487 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.59 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4644  glycogen synthase  39.26 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.755031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.71 
 
 		 483 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.55 
 
 		 497 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.86 
 
 		 489 aa  309  9e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  37.83 
 
 		 477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  38.37 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.45 
 
 		 507 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.27 
 
 		 496 aa  307  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>