More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0567 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  70.55 
 
 		 501 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 		 518 aa  1073    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  71.11 
 
 		 502 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  66.73 
 
 		 507 aa  697    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  68.22 
 
 		 506 aa  733    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  90.64 
 
 		 534 aa  999    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  49.18 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.96 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.88 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  43.29 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6185  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.69 
 
 		 525 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0114021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  47.29 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  43.18 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.21 
 
 		 487 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  43.69 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.08 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.56 
 
 		 486 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.35 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.38 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  42.21 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.67 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.84 
 
 		 480 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  42.18 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.59 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  41.79 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.59 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  42.06 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  41.98 
 
 		 498 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  41.98 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  42.2 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.5 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  42.06 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  41.86 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  41.98 
 
 		 480 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  41.98 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.01 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  41.68 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.01 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.29 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  41.56 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.69 
 
 		 475 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.04 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.15 
 
 		 475 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.7 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.56 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.74 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.31 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.89 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  40.62 
 
 		 478 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  38.27 
 
 		 488 aa  362  9e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.27 
 
 		 477 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.18 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.35 
 
 		 587 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.98 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  40.29 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  39.18 
 
 		 477 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  39.51 
 
 		 492 aa  348  1e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.32 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  40.04 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.1 
 
 		 483 aa  342  8e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  38.67 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.33 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01576  glycogen synthase  39.14 
 
 		 486 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003946  glycogen synthase ADP-glucose transglucosylase  38.7 
 
 		 485 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0239  glycogen synthase  38.14 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.4 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.46 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41777  predicted protein  38.18 
 
 		 525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112054  hitchhiker  0.00385989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  40.28 
 
 		 485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.17 
 
 		 488 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.43 
 
 		 487 aa  326  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.11 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  39.31 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.16 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.05 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  38.49 
 
 		 484 aa  319  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.4 
 
 		 460 aa  319  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.52 
 
 		 489 aa  319  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3802  glycogen synthase  40.98 
 
 		 477 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3905  glycogen synthase  40.98 
 
 		 477 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.794179  normal  0.424827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3736  glycogen synthase  40.98 
 
 		 477 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3844  glycogen synthase  40.98 
 
 		 477 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3725  glycogen synthase  40.98 
 
 		 477 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  39.43 
 
 		 487 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.78 
 
 		 493 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.79 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  39.61 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.61 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.49 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0716  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.92 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  39.34 
 
 		 478 aa  311  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.02 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  36.01 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  39.55 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  39.55 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  39.55 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  39.55 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  39.55 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>