More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0998 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  73.51 
 
 		 487 aa  756    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  80.79 
 
 		 488 aa  816    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  100 
 
 		 489 aa  1002    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  59.38 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  59.87 
 
 		 493 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  45.91 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.98 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.05 
 
 		 486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.05 
 
 		 486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.09 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  40.83 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  40.08 
 
 		 484 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.71 
 
 		 481 aa  349  6e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.17 
 
 		 475 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.96 
 
 		 488 aa  349  8e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  44.19 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.91 
 
 		 491 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.66 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.62 
 
 		 475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.04 
 
 		 477 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.18 
 
 		 502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.46 
 
 		 509 aa  336  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.79 
 
 		 499 aa  335  1e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  37.71 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.84 
 
 		 504 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.42 
 
 		 478 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  40.46 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.92 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.52 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  43.18 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.04 
 
 		 481 aa  330  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.54 
 
 		 491 aa  329  5.0000000000000004e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.76 
 
 		 482 aa  329  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.88 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.15 
 
 		 496 aa  326  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.38 
 
 		 487 aa  325  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.76 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  41.39 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  38.97 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2303  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40.73 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2678  glycogen synthase  40.73 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.53 
 
 		 497 aa  323  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.7 
 
 		 500 aa  322  8e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  36.36 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 481 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  36.16 
 
 		 480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  36.36 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  36.16 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  36.36 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  37.7 
 
 		 485 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  36.16 
 
 		 498 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.55 
 
 		 485 aa  319  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.52 
 
 		 518 aa  319  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.89 
 
 		 491 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  36.1 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  36.31 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.52 
 
 		 534 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  36.17 
 
 		 477 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.76 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  37.27 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.79 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2986  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  39.43 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  35.89 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1542  glycogen synthase  39.71 
 
 		 486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.23 
 
 		 587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.99 
 
 		 499 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 507 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.33 
 
 		 478 aa  312  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.05 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  35.68 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  38.78 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  38.48 
 
 		 484 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0346  glycogen/starch synthase ADP-glucose type  40.62 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  38.87 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0132  glycogen synthase  40.2 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.98 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.2 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2935  glycogen synthase  38.9 
 
 		 486 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540363 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  39.43 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  35.33 
 
 		 478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.26 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  34.73 
 
 		 488 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5024  glycogen synthase  37.5 
 
 		 501 aa  303  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.671586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.23 
 
 		 485 aa  303  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2043  glycogen synthase  40.45 
 
 		 486 aa  302  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  39.96 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2348  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.89 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.78 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0774  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.22 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  36.48 
 
 		 492 aa  300  5e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  37.95 
 
 		 477 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  33.2 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1988  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  42.29 
 
 		 447 aa  295  9e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.983075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  39.44 
 
 		 487 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.85 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4053  glycogen synthase  39.02 
 
 		 543 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3940  glycogen synthase  39.02 
 
 		 543 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>