More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2742 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2742  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  100 
 
 
473 aa  977    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.341368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3086  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  56.62 
 
 
468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0511779  hitchhiker  0.00761784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4723  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  52.65 
 
 
473 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.66 
 
 
489 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  39.46 
 
 
485 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  38.72 
 
 
476 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  38.46 
 
 
480 aa  292  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  38.05 
 
 
480 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.09 
 
 
478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  37.89 
 
 
476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  38.1 
 
 
478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2245  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.87 
 
 
485 aa  289  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  37.89 
 
 
476 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  37.84 
 
 
498 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  37.81 
 
 
498 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1331  glycogen synthase  36.82 
 
 
513 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  37.84 
 
 
498 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0045  glycogen synthase  36.63 
 
 
487 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  38.25 
 
 
480 aa  288  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06351  glycogen synthase  37.18 
 
 
483 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.150133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06651  glycogen synthase  36.63 
 
 
487 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.400316  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1126  glycogen synthase  35.98 
 
 
511 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.331736  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.36 
 
 
498 aa  286  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  37.84 
 
 
498 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.87 
 
 
488 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  38.83 
 
 
480 aa  286  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.05 
 
 
484 aa  286  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0609  glycogen synthase  36.55 
 
 
483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.239419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.35 
 
 
484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06651  glycogen synthase  36.97 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0004  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.45 
 
 
482 aa  283  5.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.16 
 
 
463 aa  281  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1105  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.21 
 
 
483 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.71 
 
 
482 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10411  glycogen synthase  35.76 
 
 
490 aa  279  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.2 
 
 
483 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.66 
 
 
480 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.12 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.48 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  35.91 
 
 
476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  36.92 
 
 
492 aa  274  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18831  glycogen synthase  34.1 
 
 
499 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.575027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.92 
 
 
486 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3762  glycogen synthase  34.76 
 
 
478 aa  273  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  36.4 
 
 
484 aa  272  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2518  glycogen synthase  36.61 
 
 
465 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0886  glycogen synthase  35.98 
 
 
479 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.34 
 
 
475 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  36.03 
 
 
484 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1329  glycogen synthase  35.02 
 
 
484 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147242  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06741  glycogen synthase  36.13 
 
 
483 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.537732  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.11 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  36.72 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.76 
 
 
488 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3934  glycogen synthase  34.81 
 
 
479 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.78 
 
 
587 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1582  glycogen synthase  35.76 
 
 
491 aa  269  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0042939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  35.83 
 
 
472 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.69 
 
 
494 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5336  glycogen synthase  31.56 
 
 
544 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0149389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5129  glycogen/starch synthase  35.98 
 
 
479 aa  266  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1386  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  38.33 
 
 
477 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.84 
 
 
491 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0280  glycogen synthase  34.72 
 
 
477 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.11 
 
 
504 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  36.67 
 
 
469 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  35.89 
 
 
477 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4133  glycogen synthase  34.34 
 
 
479 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.47 
 
 
491 aa  263  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03281  glycogen synthase  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000154159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0285  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000266989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3629  glycogen synthase  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3908  glycogen synthase  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0810  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.66 
 
 
448 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4741  glycogen synthase  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3895  glycogen synthase  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0283  glycogen synthase  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0220611  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03234  hypothetical protein  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000325312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3711  glycogen synthase  33.81 
 
 
477 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.14 
 
 
487 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1159  glycogen synthase  35.34 
 
 
477 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0241864  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  35.34 
 
 
477 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.41 
 
 
476 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  35.52 
 
 
478 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0226  glycogen synthase  34.13 
 
 
477 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0559  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.43 
 
 
496 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340162  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.33 
 
 
509 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.98 
 
 
481 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  33.94 
 
 
486 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  32.61 
 
 
499 aa  259  7e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.98 
 
 
481 aa  259  9e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  34.63 
 
 
484 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0512  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.4 
 
 
491 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0383001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  32.41 
 
 
556 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.24 
 
 
496 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.06 
 
 
485 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0612  glycogen synthase  33.4 
 
 
489 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3837  glycogen synthase  33.4 
 
 
478 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2742  glycogen synthase  32.87 
 
 
480 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0845  glycogen synthase  36.18 
 
 
496 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>