More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1085 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1085  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 356 aa  734    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  26.32 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.54 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 		 762 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  22.52 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  22.78 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  23.43 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.28 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  23.63 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  25.95 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.84 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.84 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.32 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.32 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  24.05 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 		 669 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  24.77 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  20.3 
 
 		 808 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.01 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.27 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  21.02 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  28.8 
 
 		 502 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  28.8 
 
 		 502 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  23.93 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 		 660 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 		 890 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0010  glycosyltransferase  26.52 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.15 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1923  glycosyltransferase  25.66 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2684  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  26.8 
 
 		 379 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.24 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.29 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.54 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  25.38 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  26.22 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0440  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.438778  normal  0.0102055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  23.89 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  21.43 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  23.14 
 
 		 743 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  26.23 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 1264 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  21.43 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  28.67 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3394  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  21.77 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  24.26 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>