More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5912 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
360 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  98.06 
 
 
360 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  80.28 
 
 
365 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  66.11 
 
 
360 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  65.01 
 
 
381 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  65.56 
 
 
387 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  65.56 
 
 
361 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  57.18 
 
 
374 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 
385 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  39.06 
 
 
393 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
382 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
382 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
382 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  38.23 
 
 
393 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 
353 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 
353 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
353 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  32.13 
 
 
343 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  34.3 
 
 
343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
355 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0028  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.038323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
358 aa  94  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
353 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
704 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  28.34 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.56 
 
 
356 aa  89.4  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  20.05 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  20.05 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  30.41 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
439 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  32.52 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  23.18 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  23.73 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.92 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  19.95 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.32 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
461 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  21.27 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  21.27 
 
 
388 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
406 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  28.03 
 
 
376 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
378 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
423 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  21.18 
 
 
384 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.32 
 
 
407 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  21.81 
 
 
394 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  28.08 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0741  glycosyltransferase-like protein  25.79 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
423 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 
341 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>