More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3626 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 393 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  94.66 
 
 		 393 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  77.92 
 
 		 385 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  71.47 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  71.47 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  71.47 
 
 		 382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  39.34 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  39.06 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  37.9 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  38.76 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.66 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.94 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  27.12 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.83 
 
 		 356 aa  116  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.3 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  30.79 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  31.94 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  26.15 
 
 		 343 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 391 aa  92.8  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 374 aa  90.1  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  26.3 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  26.92 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 704 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 904 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  27.46 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  24.71 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3453  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  22.74 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.81 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.09 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.5 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.29 
 
 		 745 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  25.33 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  21.14 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  21.14 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.33 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 750 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0028  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.038323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  20.81 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  25.89 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>