More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4205 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
382 aa  784    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
382 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  71.47 
 
 
393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  70.42 
 
 
393 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  69.35 
 
 
385 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
374 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
360 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  37.05 
 
 
381 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  36.94 
 
 
360 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.81 
 
 
387 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.01 
 
 
361 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  29.46 
 
 
343 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  28.06 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 
356 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
358 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
400 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
388 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
388 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
399 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
353 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  26.16 
 
 
343 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
371 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
401 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
369 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
704 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
382 aa  99.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  28.7 
 
 
419 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
407 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
398 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  29.71 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
353 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
353 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
388 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
353 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
378 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
392 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
374 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
390 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
378 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  24.84 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
390 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  27.84 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
385 aa  86.3  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  29.47 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  27.21 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
346 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0028  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.038323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3453  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25.73 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  28.25 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  25.73 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0741  glycosyltransferase-like protein  30.11 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
904 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.7 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  23.84 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>